enterobakter

enterobakter
Bir besleyici agar plakası üzerinde farklı görünümdeki Enterobacter cloacae kolonileri

Bir besin agar plakası üzerinde
farklı görünümdeki Enterobacter cloacae kolonileri

sistematik
Etki alanı : Bakteriler (Bakteriler)
Departman : proteobakteriler
Sınıf : Gamaproteobakteriler
sipariş : Enterobakteriler (Enterobakteriler)
Aile : enterobakterigiller
Tür : enterobakter
Bilimsel ad
enterobakter
Hormaeche & Edwards 1960 düzeltme
. Brady et al. 2013

Enterobacter a, cins ve bakteri ait aile arasında Enterobacteriaceae ait ve yaklaşık 15 türler ihtiva eder. Enterobacter cinsinin temsilcileri, insan bağırsağı da dahil olmak üzere hemen hemen tüm habitatlarda bulunur . Orada normal bağırsak florasına aittirler. Çubuk şeklinde bakteri hücreleri olankırmızı lekelide Gram soy ve bu nedenle grubuna aittir Gram- negatif bakteri. Flagella yardımıylaaktif olarak hareketedebilirler. Oksijenli veya oksijensiz yaşayabilirlerve bu nedenle fakültatif anaerobik yaşam formlarıolarak adlandırılırlar. Oksijen yoktur, bunlar neden enerji bir fermantasyonu ile. Enterobacter içintipikolanfermantasyon, 2,3-bütandiol fermentasyonudur - bu, ilgili türlerden önemli bir ayırt edici özelliktir.

Genel ifadeler patojenite ait Enterobacter bir şekilde patojen zordur: (sınıflandırmayı insanlarda hastalığa neden olabilir patojenik kabul edilmeyen türler, aynı zamanda türü bulunmaktadır risk grubuna  göre 2 Biyolojik Ajanlar Yönetmeliği ). Bu cinsin temsilcilerinin en iyi ihtimalle bağışıklık sistemi zaten zayıflamış hastalarda bulaşıcı hastalıklara neden olabilecek fırsatçı patojenler olarak görüldüğü varsayılırdı . Birkaç onyıldır gözlemlenen bazı Enterobacter türlerinin (özellikle Enterobacter cloacae ) antibiyotik direnci , hastane- nazokomiyal enfeksiyonlarda edinilen enfeksiyonlar için patojenler olarak artık artan bir öneme sahip oldukları anlamına gelmektedir . Ayrıca çeşitli genlerin filogenetik çalışmaları nedeniyle cins veya ilgili cinslerin sistematiğinin sürekli değiştiği dikkat çekmektedir . Bu, bazı bakteri türlerinin artık Enterobacter cinsine değil, bazıları yeni tanımlanmış olan diğer cinslere atanmasına yol açmıştır . Örneğin, bazı bitkilerde bulunan Enterobacter aglomerans 1989'dan beri kendi Pantoea cinsine aittir ve tıbbi açıdan ilgili türler Enterobacter aerogenes ve Enterobacter sakazakii şimdi sırasıyla Klebsiella aerogenes ve Cronobacter sakazakii olarak listelenmektedir .

özellikleri

Görünüm

Hücreler arasında , Enterobacter türleri olan çubuk şeklinde ve aktif hareketli yoluyla flagella ilgili cinsi ayırt edilmesini ikinci, Klebsiella . Flagella (aynı zamanda flagella olarak da adlandırılır) peritrich olarak düzenlenmiştir. Tek bir hücre yaklaşık 0,5 µm genişliğinde ve 2-3 µm uzunluğundadır. İn Gram boyama , hücrelerin davranan gram kullanılan boyalarla kırmızı için pembe lekeli yani, negatif. Endosporlar gibi kalıcılık biçimleri oluşmaz.

Gelen Enterobacter cloacae , bakteriyel hücre duvarı çevrili bir yan kapsül yapılmıştır polisakaritler . Biyofilm oluşumunda yer alırlar ve besin ortamında büyüyen bakteri kolonilerine sümüksü bir görünüm verirler . Bazen kapsülü olmayan hücreler vardır, büyüyen koloniler oldukça kaba görünür, bu yukarıdaki resimde görülebilir. Diğer Enterobacter türleri de bir kapsül oluşturur, ancak cins içinde tek tip bir resim yoktur. Enterobacter cinsinin temsilcileri, yaygın besin ortamlarında iyi bir büyüme gösterir. Cronobacter sakazakii'nin sarımsı renkli kolonilerinin aksine, kolonileri genellikle özellikle renkli değildir .

Büyüme ve metabolizma

Cins üyeleri Enterobacter olan chemoorganotroph i. Başka bir deyişle, enerji üretmek için organik maddeleri parçalarlar . Fakültatif anaerobiktirler : Oksijen varsa, oksidatif enerji metabolizmasını gerçekleştirebilirler , organik maddeleri karbon dioksit (CO 2 ) ve suya oksitlerler ; oksijen yoksa, yani anoksik koşullar altında , enerji üretmek için 2,3-bütandiol fermantasyonu kullanırlar. Burada son ürünler esas olarak alkol 2,3-bütandiol ve CO 2 büyük miktarlarda , diğer şeyler arasında, hem de küçük miktarları,. farklı asitler. Enterobacteriaceae familyasının diğer cinslerinde, örneğin. B. Escherichia ve Salmonella , karışık asit fermantasyonu anaerobik enerji metabolik yoludur, burada bütandiol fermantasyonunun aksine , son ürünler olarak büyük miktarlarda asitler ( asetik asit , laktik asit ve süksinik asit ) üretilir, ancak bütandiol yoktur. Bu özellik, enterobakteri cinslerini ayırt etmek için kullanılır (bkz . Kanıt bölümü ). Enterobacteriaceae için tipik olduğu gibi, katalaz testi pozitiftir ve oksidaz testi negatiftir.

Basit besleyici ortam uygundur için yetiştirilmesi ; özel bir büyüme faktörleridir gerekli. Bakteriler örneğin kazein soya pepton agar (CASO agar) üzerinde büyütülebilir, kanlı agar ve enterobakteri temsilcilerini izole etmek ve ayırt etmek için uygun seçici besleyici ortam, örneğin MacConkey agar veya eozin metilen mavisi de uygundur. - Ağar (EMB). Enterobacter türleri mezofiliktir , 30 ila 37 °C sıcaklık aralığında optimal büyüme meydana gelir, bir günlük inkübasyondan sonra 2-3 mm çapında koloniler zaten görülebilir. Bazı türler, ör. B. E. cloacae ayrıca , örneğin ılıman bir iklime sahip kıyı bölgelerinin acı sularında , daha düşük sıcaklıklarda (15-25 ° C) büyür .

kemotaksonomi

GC içeriği , yani oranı nükleobazlar guanin ve sitozin bakteriyel DNA , 52-60 olan  mol yüzdesi . Bakteri hücresinin bileşenleri antijen görevi görür ; somatik O-antijenleri ve H-antijenleri tanısal öneme sahiptir (salmonella için kullanılan Kauffmann-White şemasını karşılaştırın ).

patojenite

Enterobacter'in patojenitesi hakkında genel ifadeler zordur çünkü cinsin veya ilgili cinslerin sistematiği sürekli değişmektedir. Ayrıca, daha eski raporlarda, Enterobacter ve Klebsiella arasında genellikle bir karışıklık vardır veya net bir ayrım yoktur . Geçmişte tıbbi olarak ilgili olduğu düşünülen türler artık bu cinse ait değildir (iyi bilinen örnekler E. aerogenes ve E. sakazakii ). Uzman literatüründe, genellikle E. cloacae ve E. aerogenes için ortak ifadeler yapılır , bu nedenle son adı verilen bakteri türü Klebsiella (2017) cinsine aktarıldığında , patojeniteye ilişkin ifadelerin net bir şekilde atanması sorunludur.

20. yüzyılın ortalarında, Enterobacter türleri nadiren patojen olarak anılırdı, ancak bu durum artan antibiyotik tüketimi ile değişti . Bu arada, cinsin birkaç temsilcisi , özellikle bazı antibiyotiklere dirençli olduklarından, hastane enfeksiyonlarında ("hastane enfeksiyonları ") rol oynamaktadır. Özellikle hastanelerde meydana gelen enfeksiyonlarda bağışıklığı baskılanmış hastalar risk altındadır ; bu bağlamda idrar yolu enfeksiyonları ve bakteriyemi bildirilmiştir. E. Cancerogenus ( E. taylorae ) 1987 yılında kemik iliğinin enfeksiyöz bir iltihabı olan osteomiyelit vakasında nedensel ajan olarak adlandırılmıştır.

E. asburiae , E. bugandensis , E. cancerogenus , E. hormaechei , E. Kobei , E. ludwigii ve E. cloacae subsp. cloacae edilir  atanan risk grubuna göre 2 Biyolojik Maddeler Yönetmeliği TRBA (ile bağlantılı olarak teknik kurallar Biyolojik Maddeler için) 466 . Türleri , E. mori , E. muelleri , E. siamensis , E. soli , E. tabaci , E. xiangfangensis ve E. cloacae subsp. çözülenler risk grubu 1'e aittir (patojen olmayan olarak kabul edilirler).

kanıt

Voges-Proskauer testinde pozitif sonuç veren Enterobacter cloacae

Bakterileri çevresel örneklerden veya klinik materyalden izole etmek için Enterobacter türleri için seçici olan özel bir besin ortamı yoktur . Bunun yerine, enterobakteriler için seçici besin ortamı, aşağıdaki ilave tanımlama ile birlikte kullanılır.

biyokimyasal kanıt

Mevcut enzimler ve ortaya çıkan metabolik özellikler gibi biyokimyasal özellikler, Enterobacter türlerini tanımlamak veya onları Enterobacteriaceae'nin diğer temsilcilerinden ayırt etmek için renkli bir satırda kullanılabilir . Tipik olarak Voges-Proskauer testi kullanılır. Test , 2,3-bütandiol fermantasyonunun bir ara ürünü olan asetoini tespit eder . Enterobacter ve Klebsiella olumlu, Escherichia ise olumsuz tepki verir . Sözde IMViC test prosedüründeki diğer reaksiyonlar da Escherichia ve Enterobacter arasında ayrım yapmaya hizmet eder :

Tablo: Escherichia coli ve Enterobacter cloacae'nin IMViC reaksiyonları
Mikroorganizma indol oluşumu Metil kırmızı numune asetoin oluşumu sitrat kullanımı
Escherichia koli + + - -
enterobakter kloak - - + +

Enterobacter cinsinin temsilcileri, gaz ve asit oluşumu ile bir fermantasyonda karbonhidratlar glikoz ve laktozu kullanır Glikozun fermantasyonu, hidrojenin (H 2 ) en az iki katı kadar çok miktarda karbon dioksit (CO 2 ) üretir . Bireysel bakteri suşları söz konusu olduğunda, laktoz kullanımına ilişkin tek tip bir resim yoktur. yani, laktozu parçalayabilen suşlar olduğu gibi yapamayan suşlar da vardır. Seçici besleyici ortam durumunda, laktoz bozunması genellikle karbonhidratın fermentatif bozunması sırasında asit oluşumu yoluyla tespit edilir; besin ortamında bulunan pH göstergesi , asit oluşumunun bir sonucu olarak rengini değiştirir . Bazı suşlar, çok az asit üretildiği için negatif veya zayıf pozitif sonuç verebilir. Buna karşılık, 48 saatlik inkübasyondan sonra asit oluşumuna bağlı laktoz tespiti negatif olsa bile ONPG testi pozitiftir. Bu biyokimyasal kanıt, bakterilerin emrinde laktozun iki bileşen olan glikoz ve galaktoza hidrolize edildiği β-galaktosidaz enzimine sahip olduğunu göstermektedir .

Cinsin birçok üyesinin kullanabileceği diğer karbonhidratlar arasında örneğin monosakkaritler L - arabinoz , L - ramnoz ve D - ksiloz , disakkarit D - selobiyoz , trisakkarit rafinoz ve şeker alkolü D - mannitol bulunur . Hidrojen sülfür (H 2 S) oluşumu yoktur , öte yandan aesculin'in ayrılması pozitif olarak ilerler ve aesculin hidrolize olur. Üreaz enzimi mevcut değildir, bu nedenle üre parçalanamaz. E. gergoviae üreaz pozitif olmasına rağmen , artık cinse dahil değildir (bkz. Bölüm Sistematik ). Biyokimyasal test sistemlerinde test edilen diğer enzimlerle ilgili olarak, ornitin dekarboksilaz (ODC) mevcuttur - ODC-negatif Klebsiellae'yi ayırt etmek için önemli bir kriter - lizin dekarboksilaz (LDC) ve arginin dihidrolaz (ADH) enzimleri sadece bazılarında bulunur. türler ve bu nedenle aralarında ayrım yapmak için kullanılabilir.

Enterobacter cloacae ile aşılanmış, 1 gün süreyle inkübe edilmiş , hızlı tanımlama için standartlaştırılmış ve minyatürleştirilmiş bir test sistemi

Bireysel Enterobacter türlerinin tanımlanması için çeşitli organik bileşiklerin parçalanmasına dayanan ve oluşan metabolik ürünleri gösteren biyokimyasal testler uygundur, bunun için minyatür test sistemleri kullanılabilir. Bunun için faydalı bileşikler, örneğin, L - fukoz , D - liksoz , D - maltitol , D - melibioz , sukroz ve D - sorbitoldür .

Daha fazla kanıt

Bir serolojik farklı suşları arasındaki fark , E. cloacae mümkündür. Bu durumda, 53 somatik O antijenine karşı antikorlar ve 56 kamçılı H antijeni tarafından kurulan antijenler kullanılır. Yaklaşık 80 farklı serotip ayırt edilebilir. Ancak yöntem henüz epidemiyolojik araştırmalarda kullanılmamaktadır .

Moleküler biyolojik yöntemler, farklı Enterobacter türlerini ayırt etmek ve böylece tanımlamak için çok uygundur . PCR yöntemi ( polimeraz zincir reaksiyonu ) kullanılarak bakteri genomunun belirli kısımlarının saptanması spesifiktir . Bakteri türü için tipik olan gen segmentleri kopyalanır ( amplifiye edilir ) ve saptanır. 2012'de geliştirilen bir süreç , dnaJ olarak belirlenmiş bir nükleotid dizisinden Gerçek Zamanlı Kantitatif PCR'ye ( q-PCR ) dayanmaktadır . Bu amaçla bakteriler önce seçici besiyeri Endo-Agar üzerinde yetiştirilir ve ardından DNA'ları çıkarılır . Gen segmentiyle eşleşen bir primer çifti, mevcut gen segmentlerinin amplifikasyonunu ve nicel olarak belirlenmesini ve dolayısıyla bakterinin tanımlanmasını sağlar. Almanya amaçları geliştirilen yöntem tespit etmek için , E. cloacae olarak adlandırılan diğer türler ayırt edilir, E. cloacae oluşan (karmaşık , E. asburiae , E. cloacae , E. hormaechei , E. Kobei , E. ludwigii ve E. nimipressuralis ) ayırt edilebilir. PCR yönteminin diğer modifikasyonları da tanımlama için kullanılır, örneğin rastgele amplifiye polimorfik DNA ( RAPD ), onun varyantı AP-PCR (keyfi olarak hazırlanmış PCR, keyfi olarak - keyfi olarak seçilen primerlerle PCR) veya tekrarlayan dizi bazlı PCR ( rep-PCR). Moleküler biyolojik yöntemlere dayalı bir araştırma yöntemi , yenidoğan yoğun bakım ünitelerinde salgın salgınlar durumunda ilgili patojenleri netleştirmek için kullanılan darbeli alan jel elektroforezidir (PFGE) . PFGE ayrıca Cronobacter spp.'yi tanımlamak için kullanılır . Kullanılmış.

Kütle spektrometrisi (MS) ile birlikte MALDI-TOF yöntemini kullanarak tanımlama , Enterobacter'i saptamak için uygundur , ancak yakından ilişkili türler ( E. cloacae kompleksi olarak adlandırılan ) arasındaki ayrım güvenilir değildir. Başka bir araştırma ayrıca, MALDI-TOF MS kullanılarak E. cloacae kompleksi ile E. aerogenes (şimdi Klebsiella aerogenes ) arasında ayrım yapmanın mümkün olmasına rağmen , kompleks içindeki sınırlamanın net olmadığını göstermektedir.

Sistematik ve taksonomi

Enterobacter türlerine kadar izlenebilen bakteri tanımları 19. yüzyılın sonundan beri mevcuttur (“ Bacillus cloacae ” Jordan 1890). Eşanlamlılar için Enterobacter olan " Cloaca " Castellani & Chalmers 1919 ve " Aerobacter " Hormaeche & Edwards 1958, ama bu isimler artık geçerli değil. Cins Enterobacter değildir tipi cinsi Enterobacteriaceae ailesinin, bu cins olan Escherichia . Bu sapması bu Kural 9 ile birlikte Kural 21a terminoloji göre Bakteriyolojik Kanunu ( Bakterilerin Sınıflaması Uluslararası Kanunu 1958 yılında kurulmuş), Yargı Görüş 15 Yargı Komisyonu (örneğin "adli veya tarafsız komisyon") arasında Prokaryotların Sistematiği Uluslararası Komisyonunun ( Prokaryotların Sistematiği International Committee on , ICSP) kuruldu. Cinsin tip türü Enterobacter cloacae ( Jordan 1890) Hormaeche & Edwards 1960'tır .

Harici sistem

Enterobacter cinsi , Enterobacterales Adeolu et al. sırasına göre Enterobacteriaceae familyasına aittir . 2016, Gammaproteobacteria sınıfına aittir . 2016 yılında kurulan Enterobacterales takımı, toplamda yaklaşık 60 cinse sahip sekiz aileyi içermektedir. Enterobacterales Adeolu et al. 2016, Enterobacter cinsidir . Enterobacteriaceae, büyük bir gram-negatif bakteri grubu oluşturur; bazıları patojen olarak önemli olan Citrobacter , Escherichia , Klebsiella , Raoultella , Salmonella ve Shigella cinslerine aittir .

1960 Hormaeche ve Edwards çalışmaları bu sorun dayanıyordu cins “olarak adlandırılan Aerobacter ” (tanınmamasına türler “ile Aerobacter aerogenes ” ve “ Aerobacter cloacae ”) hem hareketli ve kendiliğinden hareketli olmayan bakteriler parça olması, sınıflandırıldı O zamanlar serolojik ve biyokimyasal testlerle zaten kanıtlanmış olan Klebsiella cinsine atanacaktı. “ Aerobacter ” yerine Enterobacter olarak yeni isim ve tipik özelliklerin tanımı, sahada çalışan bilim adamlarının yeni tanımlanan türleri net bir şekilde sınıflandırmasına yardımcı olmalıdır. Bunun bir sonucu, Enterobacter aerogenes'in 2017'de Klebsiella aerogenes olarak yeniden sınıflandırılmasıdır . Erken o 1971 kadar tanındı E. aercgenes ve K. mobilis olan homotipik eş hem türler aynı tip gerginlik beri. Enterobacter'in Klebsiella ve diğer cinslerle fenotipik benzerlikleri nedeniyle Klebsielleae kabilesine ait olduğu da geçmişte tartışılmıştır . Kabile sıralaması, Uluslararası Bakteri Adlandırma Yasası'nın (Bakteriyolojik Kod) revizyonundan (1990) bu yana artık yaygın değildir.

Daha ileri araştırmalar, farklı Erwinia türlerinin fenotipik olarak Enterobacter cinsinin türlerine benzediğini gösterdi ; bu nedenle bunlar bu cinse, örneğin Enterobacter aglomerans olarak Erwinia herbicola'ya yerleştirildi , ancak 1989'dan beri ayrı bir Pantoea cinsine aitti . Esas olarak genetik incelemeler yoluyla, örn. B. DNA-DNA hibridizasyon ve çoklu lokus dizi analizi ( MLSA burada sadece bazı genler incelendiğinde,) değiştirildi sistematiği temelde enterobakterilerin. Çok sayıda Enterobacter türünün, yeni tanımlanmış diğer cinslere ait olduğu bulunmuştur. Çalışma Brady ve diğ. 2013, böylece yol ilk bilgi ve Kosakonia , Lelliottia ve Pluralibacter , hem de cins uzun bir açıklama Cronobacter ve Enterobacter .

Dahili sistem

Enterobactersolvens'in 2004'ten 2005'e kadar olan dönemindeki araştırmalar, bunun E. cloacae'nin bir alt türü (alttür) olduğunu göstermiştir . Aynı dönemde, E. hormaechei'nin tıbbi olarak ilgili üç alt türü tanımlanmıştır, ancak bunlar yalnızca 2016'da geçerli olarak yayınlanmıştır. Yakın akraba türler arasındaki zor ayrım nedeniyle, tıbbi mikrobiyolojide E. asburiae , E. cloacae , E. hormaechei , E. kobei , E. ludwigii ve E. nimipressuralis'ten oluşan E. cloacae kompleksi terimi kullanılır . Diğer yazarlar arasında E. asburiae , E. kanserojenus , E. cloacae ve E. ludwigii yer alır .

Şu anda (Aralık 2019 itibariyle) cins aşağıdaki türleri ve alt türleri içerir, E. cloacae tür türüdür. Ek olarak, liste daha önce Enterobacter cinsine ait olan , ancak şimdi başka cinslere atanmış bakterileri de içerir ; bu, mevcut atamaya atıfta bulunularak adın arkasındaki bir okla gösterilir.

  • Enterobacter aerogenes Hormaeche & Edwards 1960 (Synonym Klebsiella mobilis Bascomb ve diğerleri 1971) → Klebsiella aerogenes ( Hormaeche & Edwards 1960) Tindall ve diğerleri. 2017, tarak. kasım
  • Enterobacter aglomerans Ewing & Fife 1972 → Pantoea aglomerans ( Ewing & Fife 1972) Gavini et al. 1989, tarak. kasım
  • Enterobacter amnigenus Izard ve ark. 1981 → Lelliottia amnigena ( Izard ve ark. 1981) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter arachidis Madhaiyan ve ark. 2010 → Kosakonia arachidis ( Madhaiyan et al. 2010) Brady et al. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter asburiae Brenner ve ark. 1988 düzeltme. Hoffmann ve ark. 2005, daha önce “CDC Enteric grup 17” olarak anıldı
  • Enterobacter bugandensis Doijad ve ark. 2016, sp. kasım
  • Enterobacter kanserojenus ( Urosevic 1966) Dickey & Zumoff 1988, tarak. kasım (Eşanlamlı Erwinia Cancerogena Urosevic 1966 (Onaylı Listeler 1980)), daha önce “CDC Enteric group 19” olarak anılırdı
  • Enterobacter cloacae ( Jordan 1890) Hormaeche & Edwards 1960
  • Enterobacter cloacae subsp. kloak ( Jordan 1890) Hoffmann ve ark. 2005 subsp. kasım
  • Enterobacter cloacae subsp. çözücüler ( Rosen 1922) Hoffmann ve ark. 2005 subsp. kasım
  • Enterobacter covanii Inoue ve ark. 2001 → Kosakonia cowanii ( Inoue ve ark. 2001) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobactersolvens ( Rosen 1922) Brenner ve ark. 1988 → E. cloacae subsp. çözücüler ( Rosen 1922) Hoffmann ve ark. 2005 subsp. kasım
  • Enterobacter gergoviae Brenner ve ark. 1980 → Pluralibacter gergoviae ( Brenner ve ark. 1980) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter helveticus Stephan ve ark. 2007 → Cronobacter helveticus ( Stephan ve ark. 2007) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter hormaechei O'Hara ve ark. 1990 düzeltme. Hoffmann ve ark. 2016, daha önce “CDC Enteric group 75” olarak anıldı
  • Enterobacter hormaechei subsp. hormaechei Hoffmann ve ark. 2016 subsp. kasım
  • Enterobacter hormaechei subsp. oharae Hoffmann ve ark. 2016 subsp. kasım
  • Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii Hoffmann ve ark. 2016 subsp. kasım
  • Enterobacter intermedius corrig. İzard et al. 1980, sp. kasım → Kluyvera intermedia ( Izard ve diğerleri 1980) Pavan ve diğerleri. 2005, tarak. kasım
  • Enterobacter kobei Kosako ve ark. 1988 düzeltme. Hoffmann ve ark. 2005, daha önce “NIH grup 21” olarak anıldı
  • Enterobacter ludwigii Hoffmann ve ark. 2005 sp. kasım
  • Enterobacter massiliensis Lagier ve ark. 2014 sp. kasım → Metakosakonia massiliensis ( Lagier et al. 2014) Alnajar & Gupta 2017, tarak. kasım
  • Enterobacter mori Zhu ve ark. 2011 sp. kasım
  • Enterobacter muelleri Kämper ve ark. 2015 sp. kasım
  • Enterobacter nimipressuralis ( Carter 1945) Brenner ve ark. 1988, tarak. kasım → Lelliottia nimipressuralis ( Carter 1945) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter oryzae Peng ve ark. 2009, sp. kasım → Kosakonia oryzae ( Peng ve ark. 2009) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter oryzendophyticus Hardoim ve ark. 2015, sp. kasım → Kosakonia oryzendophytica ( Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016, tarak. kasım
  • Enterobacter oryziphilus Hardoim ve ark. 2015, sp. kasım → Kosakonia oryziphila ( Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016, tarak. kasım
  • Enterobacter pulveris Stephan ve ark. 2008, sp. kasım → Cronobacter pulveris ( Stephan ve ark. 2008) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter pyrinus Chung ve ark. 1993, sp. kasım → Pluralibacter pyrinus ( Chung ve ark. 1993) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter radicincitans savaşçısı ve ark. 2005, sp. kasım → Kosakonia radicincitans ( söndürme ve ark., 2005) Brady ve ark. 2013, tarak. kasım
  • Enterobacter sacchari Zhu ve ark. 2013, sp. kasım → Kosakonia sacchari ( Zhu et al. 2013) Gu et al. 2014, tarak. kasım
  • Enterobacter sakazakii Farmer ve ark. 1980, sp. kasım → Cronobacter sakazakii ( Farmer ve ark. 1980) Iversen ve ark. 2008, tarak. kasım
  • Enterobacter siamensis Khunthongpan ve ark. 2014, sp. kasım
  • Enterobacter soli Manter ve ark. 2011, sp. kasım
  • Enterobacter tabaci Duan ve ark. 2016, sp. kasım
  • Enterobacter taylorae Farmer ve ark. 1985, sp. kasım → E. kanserojen ( Urosevic 1966) Dickey & Zumoff 1988, tarak. kasım
  • Enterobacter turicensis Stephan ve ark. 2007, sp. kasım → Cronobacter zurichensis ( Stephan ve ark. 2007) Brady ve ark. 2013, ad. kasım
  • Enterobacter xiangfangensis Gu ve ark. 2014, sp. kasım

Etimoloji ve Eponyms

Adı Enterobacter türetilmiştir bağırsak ( Antik Yunan ἕντερον 'bağırsak') ve Latinized kelime Bacter için antik Yunan βακτηρΐα 'çubuk', dolayısıyla gelir gibi bir şey "barsakta küçük çubuk bakteri". Bu isim fikri Alman-Danimarkalı bakteriyolog Fritz Kauffmann'dan geliyor .

Çok sayıda Enterobacter türü için, onları ilk tanımlayan bilim adamları, bir eponymi temsil eden bir sıfat seçtiler , yani özel bir addan türetilen bir kelime. E. hormaechei , Estenio Hormaeche'nin (Uruguaylı mikrobiyolog) onuruna seçildi, cinsi Philip R. Edwards ile birlikte tanımladı. Bir sıfat E. ludwigii Alman mikrobiyolog adamıştır Wolfgang Ludwig bakteri sistematiği anlayışına katkıda. Mary Alyce Fife-Asbury (ABD'li mikrobiyolog), Hans Emil Müller (Alman mikrobiyolog) ve Welton Taylor (ABD'li mikrobiyolog) , üç bilim adamının temel bilgilere sahip olduğu E. asburiae , E. muelleri ve E. taylorae'nin “babalarıydı” . Enterobacteriaceae elde edilmiş ve yayınlanmıştır.

Ancak meslektaşlarını bir eponym kullanarak onurlandıran kişiler, diğer bilim adamları tarafından bir alt türün bir sıfatıyla tersine çevrilmiştir: Caroline M. O'Hara ve Arnold G. Steigerwalt, her ikisi de Amerikalı mikrobiyolog, ilk tanımlanan E. hormaechei olabilir. bulunan E. hormaechei subsp. oharae ve E. hormaechei subsp. yine steigerwaltii .

oluşum

Hormaeche ve Edwards , 1960 yılından kalma önerilen bir Enterobacter cinsi makalelerinde , o zamanlar “ doğada yaygın olarak dağılmış ” olarak bilinen iki Enterobacter türünün oluşumunu açıklar . “(Almanca: 'Doğada yaygın.'). Hatta yıl sonra, bu açıklama hala doğrudur, fakat belirtirken ekolojiyi ait Enterobacter , edilmelidir cinsi veya ilgili cins sistematiği değişti ne sıklıkta kaydetti. Örneğin, bitkilerle ilişkili bir bakteri önce Erwinia herbicola , ardından Enterobacter aglomerans ve şimdi de Pantoea aglomerans olarak adlandırıldı .

Cinsin temsilcilerinin doğal yaşam alanları su kütleleri , kanalizasyon , acı su , bitkiler ve topraktır . Çeşitli türleri de bulunur deri ve bağırsak ait insanlarda ve hayvanlarda içinde, et , çiğ süt ve hastaneler . Hayvanda da meydana tezgahları aerosoller kadar 10 büyüklük sırasına göre 4 koloni oluşturan birimlerin metreküp hava başına. Gıdada bulunursa , üretim sürecinde kontaminasyon olduğu varsayılır; bu, örneğin yoğurt ve peynir gibi süt ürünleri için geçerlidir ve ayrıca toz bebek maması için de geçerli olabilir . Gibi tıbbi örneklerde idrar , dışkı , kan , balgam ve yaralar olan E. asburiae , E. cancerogenus , E. cloacae subsp. cloacae ve E. hormaechei tespit edildi. Buna karşılık, Enterobacter cloacae subsp. Çözünenler sadece çevresel örneklerde bulundu; ilk olarak 1922'de çürüyen saplardan izole edildi. E. soli 2011 yılında topraktan izole edilmiştir ve lignini parçalayabilmektedir.

Son yıllarda keşfedilen cinsin bazı üyeleri ( E. bugandensis , E. kobei , E. ludwigii ve E. massiliensis ) tıbbi test materyallerinde keşfedilmiştir, ancak bunlar mutlaka patojen değildir. E. massiliensis , bağırsak florasının sistematik bir çalışmasının parçası olarak Senegal'den sağlıklı bir genç adamın dışkı örneğinden izole edildi. Çeşitli türler de çevresel örneklerden tıbbi muayene malzemede gerçekleşmelerine ek olarak izole edilmiştir, E cancerogenus ağaçlar, su ve gıda, E. Kobei gıdalar ve gelen E. ludwigii toprak veya bitkilerden. Diğer Enterobacter türleri bitkilerden izole edilmiştir ve mevcut bilgi durumuna göre bunlar için tipiktir; B. E. mori gelen köklerinin bir hastalıklı dut ağacı Morus alba L. ( dut ) ya da E. muelleri gelen rizosferde ve Zea mays L. ( mısır ).

önem

biyoteknoloji

2,3-bütandiol fermantasyonunun metabolik ürünleri
(S) -Asetolaktat Yapısal Formül V1.svg
asetolaktat, asetil laktat
(R) -asetoin.svg
Asetoin, 3-hidroksi-2-bütanon
Butanedion - Butanedione.svg
Diasetil, 2,3-bütandion

Bazı Enterobacter enzimleri , bakterinin veya genlerinin biyoteknolojik kullanımına yol açabilir . Bu durumda, enzim α-asetolaktat dekarboksilazı (olacaktır Acetyllactatdecarboxylase ) 2,3-bütandiol fermentasyonda, burada kullanılan dekarboksilasyon arasında Acetyllactat (Acetyllactat aynı zamanda 2-asetolaktat ve α-asetolaktat ifade olarak da bilinir neden olduğu anyonu 2 - Hidroksi-2-metil-3-oksobütirik asit), bu sayede asetoin oluşur. Öte yandan, asetil laktat, enzimlerin etkisi olmadan oksidatif dekarboksilasyona uğrayabilir ve böylece diasetil'e dönüştürülebilir . Diasetil, düşük konsantrasyonda belirgin bir tereyağı tadı ve kokusuna sahip olan ve aynı zamanda doğal tereyağı aromasının bir parçası olan organik bir bileşiktir . Öte yandan, şarap ve birada lezzet bozulmasına neden olabilir . Diasetil , bira mayası Saccharomyces cerevisiae ile demleme işlemi sırasında meydana gelen diasetil redüktaz yardımı ile enzimatik olarak asetoine indirgenebilir . Bununla birlikte, istenmeyen kokulara yol açan küçük miktarlarda diasetil ortaya çıkabilir. Α-asetolaktat dekarboksilazı gen nedenle transfer edildi Enterobacter tarafından transformasyonu içine Saccharomyces cerevisiae . Rekombinant maya diasetilin konsantrasyonunu etkin olması wort düşük demleme işlemi sırasında asetil laktat hemen asetoyine doğrudan dönüştürüldü gibi.

Buna karşılık, diasetil aroma maddesi olarak da kullanılır , bu nedenle biyoteknolojik üretimi ilgi çekicidir. Bu amaçla, bir E. cloacae subsp. α-asetolaktat dekarboksilaz enziminin genini, gen nakavtıyla "kapatılan" çözer . Ayrıca, diasetil'i asetoine indirgeyen enzimlerin genleri de etkisiz hale getirilmiştir. Genetik olarak modifiye edilmiş bakteriler daha sonra üretilen diasetil a fermenter . Verimi artırmak için demir (III) iyonlarının (Fe 3+ iyonları) eklenmesinin yararlı olduğu kanıtlanmıştır . Bu, fermenter broth içindeki diasetil konsantrasyonunu 1,45 g / L'ye yükseltti.

Antibiyotik direnci

Bir antibiyotik direnci , belirli bir bakteri oluşur dirençli Belli bir ( "dirençli") antibiyotik , bu nedenle bu artan derecede önlenmediğini. Başka bir deyişle, antibiyotik bakteriye karşı etkili değildir. Bakteriler söz konusu olduğunda, bazen doğal (ly ) ve kazanılmış ( kazanılmış ) direnç arasında bir ayrım yapılır .

Enterobacter cinsinin temsilcileri, bakteriyel kromozomlarında gen ürünü sefalosporinaz enzimi olan indüklenebilir bir gen segmentine sahip olduklarından, belirli β-laktam antibiyotiklere karşı doğal bir dirence sahiptir . Sefalosporinazlar, bu antibiyotik grubunun β-laktam halkasını bölerek onları etkisiz hale getiren β-laktamazların bir alt grubudur. Enterobacter cloacae kompleksinin bakteriyel suşları ( E. asburiae ve E. hormaechei dahil ) bu nedenle aminopenisilinlere ve birinci nesil sefalosporinlere dirençlidir . Öte yandan, karboksipenisilinlere duyarlıdırlar, bazı antibiyotikler 2. nesil sefalosporinler ile etkilidir ve çoğu antibiyotik 3. nesil sefalosporinler ile etkilidir. Gen , AmpC beta-laktamaz adı verilen enzimi (bu durumda bir sefalosporinaz) ampC kodlar . 2008 yılında yapılan bir araştırmaya göre incelenen tüm Enterobacter izolatlarında bulunmaktadır. Bir mutasyon yol açabilir aşırı ifadesi sonucu, yüksek kuşak ve sefalosporinlere direnci, bakteriyel kromozom içinde kodlanan AmpC-beta-laktamaz ve sefamisinler gibi sefoksitin , sefotetan ve cefmetazol .

Edinilmiş direnç genleri genellikle bir plazmit üzerinde bulunur . Bu, örneğin plazmit kodlu penisilinaz veya plazmit kodlu genişletilmiş spektrumlu β-laktamaz ( ESBL ) için geçerlidir. Enterobacter cloacae kompleksinin bakteriyel suşları, kazanılmış bir direnç yoluyla karboksipenisilinleri (örn. karbenisilin ) ve üreidopenisilinleri ( mezlosilin ) ve ayrıca 3. nesil sefalosporinleri (örn. sefotaksim ) inaktive edebilir . Bu, MRGN sisteminde tanımlanan dört antibiyotik sınıfından ikisine (çok dirençli gram-negatif bakteriler) dirençli oldukları anlamına gelir . Enterobacter spp'de bir çoklu direnç vardır . daha ziyade kromozom olarak kodlanmış AmpC'nin aşırı ekspresyonundan kaynaklanır, ayrıca plazmit kodlu bir ESBL de oluşur. ECDC ( Avrupa Hastalık Önleme ve Kontrol Merkezi) tarafından hazırlanan bir rapora göre 2016 yılında Enterobacter izolatlarının %32'si 3. nesil sefalosporinlere direnç göstermiştir; bu veriler Avrupa sürveyans sistemi TESSy'den gelmektedir.

Son zamanlarda, karbapenemlere ve dolayısıyla MRGN sisteminde tanımlanan dört antibiyotik sınıfından birine dirençli olan Enterobacter cinsinin temsilcileri rapor edilmiştir . Karbapenemlere direnç hala oldukça nadirdir ve porin kaybı ile birlikte yukarıda bahsedilen AmpC-beta-laktamaz veya GSBL'den kaynaklanabilir . Ancak karbapenemaz üreten temsilciler de zaten izole edilmiştir. 2010 yılında Almanya'da VIM-1 (Verona-Integron-Metallo-β-Lactamaze), E. cloacae'de en sık tanımlanan karbapenemazdı. ECDC raporuna göre Enterobacter spp. İzolatlar karbapenemlere direnç göstermiş; 2016 yılında 14 ülkeden TESSy kapsamında toplanan verilerden 1.435 izolat incelenmiştir. Yine 2013 yılında ECDC tarafından yayınlanan , karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae (EuSCAPE) üzerine Avrupa araştırması hakkındaki ara rapor, Enterobacter spp. Enterobacteriaceae'de karbapenemaz üretimi açısından baskın tür. Eyaletlerin çoğu (33) ise en önemli temsilci olarak Klebsiella pneumoniae adını verdi . Bu bakteri türünden adını alan karbapenemazlar ( KPC-1 , KPC-2, vb.) Klebsiella türleri ile sınırlı değildir , fakat -plazmit kodlu olduklarından- farklı gram-negatif bakteri türleri arasında yatay gen transferi ile değiş tokuş edilebilirler . 2004 yılında, plazmit kodlu KPC-2 β-laktamaz (bu durumda bir karbapenemaz) içeren Enterobacter izolatları ilk kez rapor edilmiştir. İzolatların alındığı hasta 2001 yılında Boston'daki bir hastanede tedavi görmüş ve çeşitli bakterilerin neden olduğu sepsis hastalığına yakalanmıştı . Başlangıçta belirtilmemiş olan Enterobacter izolatları, kesin bir atama mümkün olmamasına rağmen, çeşitli test yöntemleri kullanılarak E. cloacae veya E. asburiae olarak tanımlandı.

1970'de tüm E. cloacae suşları bir aminoglikozit antibiyotik olan gentamisin'e duyarlıyken , bu 1970'lerde hızla değişti. Bu plazmid, üzerinde bulunan AME genleri kaynaklanmaktadır kod aminoglikosid değiştirici enzimler için artık etkili bir şekilde bu antibiyotik grubunun yapısı değişir. Gentamisin'e ek olarak, Tobramisin ve Amikasin etkilenir.

Antibiyotik direnci laboratuvarda bir antibiyogram kullanılarak belirlenir . Kirby-Bauer yöntemi burada sıklıkla kullanılır, burada bir agar difüzyon testinde, çeşitli antibiyotikler içeren küçük dairesel filtre plakaları, bakterinin dağıtılmış bir süspansiyonu ile Müller-Hinton agar üzerine yerleştirilir. Enterobacter türlerinin birkaç başlangıç ​​tarifi, örneğin E. bugandensis , E. hormaechei ve E. massiliensis gibi bu antibiyogramların sonuçlarını içerir .

PCR yöntemi de kullanılabilir. Antibiyotikleri parçalayan veya değiştiren enzimleri kodladıkları için bakterilerin antibiyotik direncinden sorumlu olan genleri hedef alır ve böylece onları etkisiz hale getirir. 2015 yılında Cezayir (27 örnek) ve Fransa'da (50 örnek) hastane enfeksiyonlarına (“hastane enfeksiyonları”) karışan ve E. cloacae olduğu varsayılan 77 Enterobacter izolatı PCR kullanılarak test edilmiştir . PCR yöntemi, 29 izolatın en az bir ESBL kodlayan gene sahip olduğunu ve 28 izolatın AME genlerine (aminoglikozid değiştirici enzimler) sahip olduğunu gösterdi. Pozitif sonuçların nispi ve mutlak sıklığı, Cezayir'den (18 ve 20) alınan numunelerde, Fransa'dan (11 ve 8) alınan numunelere göre daha fazlaydı.

Tıbbi önemi

Cins içinde kalan türlerin insan tıbbi önemi hala araştırma konusudur. Patojenite bölümünde bahsedilen Enterobacter türlerinin neden olduğu bulaşıcı hastalık vakalarına ek olarak, alt solunum yollarının bulaşıcı hastalıklarını , pnömoniyi , cilt ve yumuşak doku bulaşıcı hastalıklarını ve oftalmik hastalıkları da etkilediklerine inanılmaktadır . göz) enfeksiyon hastalıkları, Endokardit yanı sıra septik artrit sorumlu olabilir. Vakaların çoğu hastane kaynaklı (nozokomiyal) enfeksiyonlardır. Hastanedeki tıbbi örneklerden izole edilen veya hastane kaynaklı bulaşıcı hastalıklarla ilişkili türler fırsatçı patojenler olarak kabul edilir . Sorun, birkaç antibiyotiğe karşı yaygın dirençtir, bu nedenle hastane bulaşıcı hastalıklar için patojenler olarak artan önemleri vardır. Buna karşılık, Cronobacter sakazakii'nin aksine , Enterobacter türleri gıda enfeksiyonlarında epidemiyolojik bir rol oynamamaktadır .

Hastanelerde meydana gelen enfeksiyonlar esas olarak bağışıklığı baskılanmış hastaları etkiler . Ayrıca erken doğum , düşük doğum ağırlığı, invaziv tıbbi prosedür kullanımı ve aşırı antibiyotik kullanımı gibi kriterler risk faktörleri ise yenidoğanlar risk altındadır. E. cloacae ve E. hormaechei ilişkili yenidoğan bulaşıcı hastalıklar , hem de C sakazakii'nin ( nekrotizan enterokolit olarak Cronobacter enfeksiyonlar), K. aerogenes ve Pluralibacter gergoviae , burada artık aittir cinsine . E. hormaechei ve Cronobacter türleri arasındaki ayrım konusunda geçmişte daha sık yanlış sonuçların olduğu unutulmamalıdır . Pnömoniler v. bir. Yoğun bakımda ventile edilen hastalar etkilendi. 2016 yılında bir yoğun bakım ünitesinde edinilen pnömoninin %10'unun nedeni olarak Enterobacter türleri olarak adlandırılan bir ECDC raporu (karşılaştırma için: Pseudomonas aeruginosa %21, Staphylococcus aureus %18, Klebsiella spp. %16 ve Escherichia coli %13).

Enterobacter türleri ile enfeksiyon durumunda , direnci netleştirmek için önce bir antibiyogram yapılmalıdır. Çoğu zaman, 3. nesil ureidopenicillins ve sefalosporinler (örneğin sefotaksim ve seftazidim ) kullanılır, ancak etkili değildir bir penisilinaz plazmid kodlu ya da plazmid kodlu multi dirençli türler geniş spektrumlu β-laktamaz . Kullanılan diğer antibiyotikler karbapenemler, kinolonlar ve aminoglikozidlerdir. Kromozomal olarak kodlanmış AmpC-beta-laktamaza (bu durumda bir sefalosporinaz) dirençli Enterobacter türleri için karbapenemler önerilir, ancak bu antibiyotik grubuna da direnç gelişebileceği unutulmamalıdır.

Tıbbi öneme ilişkin verilerin çoğu, E. cloacae türü türünde bulunabilir . 1966'da bir enfeksiyondan sorumlu olmak yerine hastanedeki hastaları kazara kolonize ettiği bildirildi . 1970'lerde, belirli bir E. cloacae suşunun belirli bir hastaneye endemik olduğuna ve bağışıklığı baskılanmış hastalarda bulaşıcı hastalıklara neden olan fırsatçı bir patojen olduğuna inanılıyordu . Hijyen incelemeleri suşu hemşire kontamine elleri ile ve bu yayılma olduğunu göstermiştir çapraz kontaminasyon meydana tıbbi cihaz ve sıvılar ile (örneğin, kullanılan su su tedavisi değil, aynı zamanda dezenfektanlar ile benzalkonyum klorür ) . Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinden (CDC) alınan istatistiklere göre , E. cloacae 1984 ve 1984 yıllarında ABD hastanelerindeki tüm nozokomiyal enfeksiyon hastalıklarının % 4,6'sından sorumluydu.

İzleme programları

Bulaşıcı hastalıklar ve dahil olan patojenler hakkında epidemiyolojik olarak faydalı bilgiler toplamak için çeşitli izleme programları (gözetim programları olarak adlandırılan) vardır. In 2015, Robert Koch Enstitüsü (RKI) bir yayınlanan patojenler ve direnç için gözetim sistemlerinin genel Almanya için. Hijyen ve Çevre Tıbbı Enstitüsü , Charité Berlin ve Çevre Tıbbı ve Hastane Enstitüsü'ndeki Hastane Enfeksiyonlarının Gözetimi Ulusal Referans Merkezi tarafından düzenlenen yoğun bakım ünitelerinde (SARI) antibiyotik kullanımı ve bakteri direncinin sürveyansını listeler . Freiburg Üniversitesi'nde Hijyen . SARI programında örnekler 13 yaygın patojen ve bunların antibiyotik dirençleri için incelenir, E. cloacae listelenen bakterilerden biridir. Hastanelerin bu sürveyansa katılımı isteğe bağlıdır. Buna karşılık, Enfeksiyon Koruma Yasası'nın (IfSG) gereklilikleri zorunludur. Örneğin, § 23  IfSG, hastane kaynaklı bulaşıcı hastalıkların ve özel dirençli ve çoklu dirençli patojenlerin kaydedilmesini şart koşar . Detaylar, Robert Koch Enstitüsü'nde kurulan ve Federal Sağlık Gazetesi'nde yayınlanan bir listede yayınlanan anti-enfektifler, direnç ve terapi komisyonu tarafından belirleniyor . Listelenen bakteriler arasında ayrıca , imipenem veya meropeneme karşı tek bir direnç veya 3 MRGN veya 4MRGN için KRINKO tanımına göre bir çoklu direnç gözlemlenmesi şartıyla, tespit edilmesi gereken E. cloacae vardır. KRINKO kısaltması, yine RKI'de kurulmuş olan Hastane Hijyeni ve Enfeksiyon Önleme Komisyonu'nun kısaltmasıdır .

İzleme sistemleri de uluslararası olarak kurulmuştur, örneğin karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae (EuSCAPE) üzerine Avrupa araştırması . Avrupa Birliği'nin 28 üye ülkesi , İzlanda, Norveç, yedi (potansiyel) aday ülke ve İsrail bu gözetim sistemine dahil olmaktadır . 2013'te yayınlanan bir ara rapor, bu 38 eyaletten 28'inin karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae (CPE) için ulusal bir sürveyans sistemi sürdürdüğünü ve Enterobacter türlerinin 24 ulusal programda da kullanıldığını göstermektedir . denetimli. Başka bir Avrupa sürveyans sistemi TESSy (Avrupa Gözetim Sistemi) olarak adlandırılır ve ECDC tarafından yıllık olarak sürveyans raporları olarak yayınlanan ve Enterobacter türlerini de dikkate alan hastane enfeksiyonları hakkında veri sağlar .

Enterobacter türlerinin neden olduğu bulaşıcı hastalıkların oluşumu hakkında bilgi verilmesi durumunda , türlerin birbirinden ve Klebsiella ve Cronobacter gibi ilgili cinslerden tanısal olarak zor ayrılması dikkate alınmalıdır. Alman Hastane Enfeksiyon Gözetim Sistemi (KISS) tarafından hazırlanan bir rapora göre, 2011 yılında yoğun bakım ünitelerinde tüm hastane kaynaklı enfeksiyon hastalıklarının % 6,5'inden Enterobacter türleri sorumluydu. Kuzey ve Güney Amerika, Avrupa ve Asya için yoğun bakım ünitelerindeki bulaşıcı hastalık salgınlarına ilişkin sürveyans programlarından ve vaka çalışmalarından elde edilen veriler mevcuttur.

kabarma

Edebiyat

Bireysel kanıt

  1. ↑ a b c d e f g h i j E. Hormaeche, PR Edwards: Önerilen bir Enterobacter cinsi. İçinde: Uluslararası Bakteriyolojik Adlandırma ve Taksonomi Bülteni . Cilt 10, No. 2, Nisan 1960, sayfa 71-74, doi : 10.1099 / 0096266X-10-2-71 .
  2. ↑ bir b c d e f g h i j k l m Carrie Brady Ilse Cleenwerck, Stephanos Venter Teresa Coutinho, Paul De Vos: cinsi Enterobacter taksonomik değerlendirme çok konumlu sekans analizine göre (MLSA): Teklif E. sokulması için nimipressuralis ve E. amnigenus, Lelliottia gen. kasım. Lelliottia nimipressuralis tarağı olarak. kasım ve Lelliottia amnigena tarağı. kasım, sırasıyla, E. gergoviae ve E. pyrinus, Pluralibacter gen. kas. Pluralibacter gergoviae tarağı olarak. kasım ve Pluralibacter pyrinus tarağı. kasım, sırasıyla, E. covanii, E. radicincitans, E. oryzae ve E. arachidis, Kosakonia gen. kas. Kosakonia cowanii tarağı olarak. Kasım, Kosakonia radicincitans tarağı. Kasım, Kosakonia oryzae tarağı. kasım ve Kazak arachidis tarağı. kasım, sırasıyla ve E. turicensis, E. helveticus ve E. pulveris, Cronobacter zurichensis nom olarak Cronobacter'e dönüştürülür. Kasım, Cronobacter helveticus tarağı. kasım ve Cronobacter pulveris tarağı. Kasım, sırasıyla ve Enterobacter ve Cronobacter cinslerinin değiştirilmiş tanımı. İçinde: Sistematik ve Uygulamalı Mikrobiyoloji . Cilt 36, Sayı 5, Temmuz 2013, sayfa 309-319, doi : 10.1016 / j.syapm.2013.03.005 .
  3. ^ A b S. D. Salas, GG Geesey: Enterobacter cloacae'nin bir tortu izolatının yüzey eki. İçinde: Mikrobiyal Ekoloji . Cilt 9, Sayı 4, Aralık 1983, s. 307-315, doi : 10.1007 / BF02019020 .
  4. ↑ a b c d Swapnil Doijad, Can Imirzalioglu, Yancheng Yao, Niladri Bhusan Pati, Linda Falgenhauer, Torsten Hain, Bärbel U. Foesel, Birte Abt, Jörg Overmann, Mariam M. Mirambo, Stephen E. Mshana, Trinad Chakrabordensis: Enterobacter bu sp. kasım, yenidoğan kanından izole edilmiştir. İçinde: Uluslararası Sistematik ve Evrimsel Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 66, Şubat 2016, s. 968-974, doi : 10.1099 / ijsem.0.000821 .
  5. ^ Bir b c Herbert Hof Rüdiger Dorries: Çift serisi: Tıbbi Mikrobiyoloji . 3. Baskı. Thieme Verlag, Stuttgart 2005, ISBN 978-3-13-125313-2 , s. 397-398 .
  6. ↑ a b c d e f g h F. Grimont, PAD Grimont: The Genus Enterobacter. İzolasyon, kimlik. İçinde: Prokaryotlar. Bakteri Biyolojisi Üzerine Bir El Kitabı, Cilt 6. 2006, s. 205-208.
  7. ↑ a b c d Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock Mikrobiologie. Almanca çeviri Werner Goebel tarafından düzenlendi, 1. baskı. Spektrum Akademischer Verlag GmbH, Heidelberg / Berlin 2000, ISBN 3-8274-0566-1 , s. 531-536.
  8. ^ A b F. Grimont, PAD Grimont: Cins Enterobacter. Serotipleme. İçinde: Prokaryotlar. Bakteri Biyolojisi Üzerine Bir El Kitabı, Cilt 6. 2006, s. 209-210.
  9. ↑ a b c d e f g F. Grimont, PAD Grimont: The Genus Enterobacter. Ekoloji ve Epidemiyoloji. İçinde: Prokaryotlar. Bakteri Biyolojisi Üzerine Bir El Kitabı, Cilt 6. 2006, s. 200-202.
  10. ↑ a b c B. J. Tindall, G. Sutton, GM Garrity: Enterobacter aerogenes Hormaeche ve Edwards 1960 (Onaylı Listeler 1980) ve Klebsiella mobilis Bascomb ve ark. 1971 (Onaylı Listeler 1980), Onaylı Listelerde aynı isimlendirme tipini (ATCC 13048) paylaşır ve Klebsiella mobilis Bascomb et al. 1971 (Onaylı Listeler 1980). İçinde: Uluslararası Sistematik ve Evrimsel Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 67, Şubat 2017, s. 502-504, doi : 10.1099 / ijsem.0.001572 .
  11. ↑ a b Carol Iversen, Niall Mullane, Barbara McCardell, Ben D. Tall, Angelika Lehner, Séamus Fanning, Roger Stephan, Han Joosten: Cronobacter gen Kasım, Enterobacter sakazakii'nin biyogruplarını barındıracak yeni bir cins ve Cronobacter'in önerisi sakazakii gen. kasım, tarak. Kasım, Cronobacter malonaticus sp. kas., Cronobacter turicensis sp. kas., Cronobacter muytjensii sp. kas., Cronobacter dublinensis sp. kasım, Cronobacter genomospecies 1 ve üç alt türden, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. Kasım, Cronobacter dublinensis subsp. lausannensis subsp. kasım ve Cronobacter dublinensis subsp. laktarid subsp. kasım .. İçinde: Uluslararası Sistematik ve Evrimsel Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 58, Haziran 2008, s. 1442-1447, doi : 10.1099 / ijs.0.65577-0 .
  12. ↑ a b c d e f g h S. Cooney, S. O'Brien, C. Iversen, S. Fanning: Bakteriler: Diğer Patojenik Enterobacteriaceae - Enterobacter ve Diğer Cinsler . İçinde: Yamine Motarjemi, Gerald Moy, Ewen Todd (Ed.): Gıda Güvenliği Ansiklopedisi . 1. baskı. Academic Press, San Diego, CA 2014, ISBN 978-0-12-378612-8 , s. 433-436 .
  13. ↑ TRBA (Biyolojik Ajanlar için Teknik Kurallar) 466: Prokaryotların (bakteriler ve arkeler) risk gruplarına göre sınıflandırılması. In: internet sitesine Mesleki Güvenlik ve Sağlık Federal Enstitüsü (BAuA). 25 Ağustos 2015, s. 148–149 , 26 Aralık 2019'da erişildi (son değişiklik 14 Ağustos 2019'da).
  14. ↑ a b c d C. M. O'Hara, AG Steigerwalt, BC Hill, JJ Farmer III, GR Fanning, DJ Brenner: Enterobacteriaceae familyasının yeni bir türü, eskiden enterik grup 75 olarak bilinir. In: Journal of Clinical Microbiology . Cilt 27, No. 9, Eylül 1989, sayfa 2046-2049, PMID 2778068 , PMC 267735 (serbest tam metin).
  15. ↑ a b c d e f g h i Carol Iversen: Enterobacter . İçinde: Carl A. Batt, Mary-Lou Tortorello (Ed.): Gıda Mikrobiyolojisi Ansiklopedisi . 2. Baskı. Academic Press, San Diego, CA 2014, ISBN 978-0-12-384730-0 , s. 653-658 .
  16. ↑ a b c Uwe Ullmann: Enterobacter . İçinde: Gholamreza Darai, Michaela Handermann, Hans-Günther Sonntag, L. Zöller (Ed.): İnsan bulaşıcı hastalıkları sözlüğü : patojenler, semptomlar, tanı, tedavi ve profilaksi . 4. baskı. Springer-Verlag, Berlin 2012, ISBN 978-3-642-17157-4 , s. 274-275 .
  17. ↑ a b Melanie Pavlovic, Regina Konrad, Azuka N. Iwobi, Andreas Sing, Ulrich Busch, Ingrid Huber: Enterobacter cloacae kompleksi içinde hızlı tür tanımlaması için MALDI-TOF MS ve gerçek zamanlı PCR kullanan ikili bir yaklaşım. İçinde: FEMS Mikrobiyoloji Mektupları . Cilt 328, No. 1, Mart 2012, s. 46-53, PMID 22150997 , doi : 10.1111 / j.1574-6968.2011.02479.x .
  18. ↑ I. Proudy, D. Bouglé, E. Coton, Coton M., R. Leclercq, M. Vergnaud: Enterobacter sakazakii izolatlarının PFGE, BOX-PCR ve fliC geninin dizilenmesi ile genotipik karakterizasyonu. İçinde: Uygulamalı Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 104, No. 1, Ocak 2008, s. 26-34, doi : 10.1111 / j.1365-2672.2007.03526.x , PMID 17850301 .
  19. ↑ a b c Nour Chems el Houda Khennouchi, Lotfi Loucif, Nafissa Boutefnouchet, Hamoudi Allag, Jean-Marc Rolain: MALDI-TOF MS, Genişletilmiş Spektrumlu-β-Laktamaz- ve ArmA Metiltransferaz Üreten Hastane Salgınını Tespit Etme Aracı olarak Cezayir'de Enterobacter cloacae Klinik İzolatları. İçinde: Antimikrobiyal Ajanlar ve Kemoterapi . Cilt 59, Sayı 10, Ekim 2015, sayfa 6477-6483, doi : 10.1128 / AAC.00615-15 , PMID 26239991 , PMC 4576089 (serbest tam metin).
  20. ^ A b F. Grimont, PAD Grimont: Cins Enterobacter. Giriş. İçinde: Prokaryotlar. Bakteri Biyolojisi Üzerine Bir El Kitabı, Cilt 6. 2006, s. 197-200.
  21. ↑ a b Onaylı Bakteri İsimleri Listeleri . İçinde: VBD Skerman, Vicki McGowan, PHA Sneath (Eds.): International Journal of Systematic Bacteriology . bant 30 , hayır. 1 , 1980, s. 362 , doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .
  22. ↑ a b c d e f g h i j k Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Genus Enterobacter. İçinde: İsimlendirmede Duran (LPSN) olan Prokaryotik isimlerin listesi . 27 Aralık 2019'da alındı .
  23. ↑ M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, RS Gupta: Genom tabanlı filogeni ve 'Enterobacteriales' taksonomisi: Enterobacterales ord. kasım Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam familyalarına ayrılmıştır. Kasım, Pectobacteriaceae familyası. Kasım, Yersiniaceae fam. Kasım, Hafniaceae familyası. Kasım, Morganellaceae fam. Kasım ve Budviciaceae fam. kasım İçinde: Uluslararası Sistematik ve Evrimsel Mikrobiyoloji Dergisi. bant 66 , Aralık 2016, s. 5575-5599 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001485 .
  24. ↑ a b S. Bascomb ve diğerleri: Klebsielleae Kabilesinin Sayısal Sınıflandırması. İçinde: Genel Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 66, No. 3, Haziran 1971, sayfa 279-295, doi : 10.1099/00221287-66-3-279 .
  25. ^ Bir b Francoise Gavini Joris Mergaert Amor Beji Christine Mielcarek Daniel Izard Karel Kersters Jozef de Ley: ., Enterobacter agglomerans Transferi (1888 Beijerinck) Ewing ve Pantoea gen Fife 1972 Kasım Pantoea aglomerans tarağı olarak. kasım ve Pantoea dispersa sp.'nin Tanımı. kas.. İçinde: Uluslararası Sistematik Bakteriyoloji Dergisi . Cilt 39, No. 3, Temmuz 1989, sayfa 337-345, doi : 10.1099/00207713-39-3-337 .
  26. ↑ a b c Harald Hoffmann, Sibylle Stindl, Wolfgang Ludwig, Anita Stumpf, André Mehlen, Jürgen Heesemann, Daniel Monget, Karl H. Schleifer, Andreas Roggenkamp: Enterobacter çözünenlerinin E. cloacae tarağı alt türlerinin çözünmesi olarak Enterobacter cloacae'ye yeniden atanması kasım ve Enterobacter asburiae ve Enterobacter kobei'nin değiştirilmiş açıklaması. İçinde: Sistematik ve Uygulamalı Mikrobiyoloji . Cilt 28, Sayı 3, Nisan 2005, sayfa 196-205, doi : 10.1016 / j.syapm.2004.12.010 .
  27. ↑ a b Harald Hoffmann, Sibylle Stindl, Wolfgang Ludwig, Anita Stumpf, André Mehlen, Daniel Monget, D. Pierard, S. Ziesing, Jürgen Heesemann, Andreas Roggenkamp, ​​​​Karl H. Schleifer: Enterobacter hormaechei subsp. oharae subsp. kasım., E. hormaechei subsp. hormaechei tarağı. kasım. ve E. hormaechei subsp. steigerwaltii subsp. Kasım, Klinik Öneme Sahip Üç Yeni Alt Tür. İçinde: Klinik Mikrobiyoloji Dergisi . Cilt 43, Sayı 7, Temmuz 2005, sayfa 3297-3303, doi : 10.1128 / JCM.43.7.3297-3303.2005 .
  28. ↑ a b c Jean-Christophe Lagier, Khalid El Karkouri, Ajay Kumar Mishra, Catherine Robert, Didier Raoult, Pierre-Edouard Fournier: Bitişik olmayan-bitmiş genom dizisi ve Enterobacter massiliensis sp. kasım İçinde: Genomik Bilimlerde Standartlar . Cilt 7, Sayı 3, Şubat 2013, sayfa 399-412, doi : 10.4056 / sig.3396830 .
  29. ↑ Seema Alnajar, Radhey S. Gupta: Filogenomik ve karşılaştırmalı genomik çalışmalar, Enterobacteriaceae familyası içindeki altı ana klad tanımlar ve ailenin birkaç polifiletik üyesinin yeniden sınıflandırılmasını destekler. İçinde: Enfeksiyon, Genetik ve Evrim . Cilt 54, Ekim 2017, sayfa 108–127, doi : 10.1016 / j.meegid.2017.06.024 .
  30. ↑ VDI 4255 sayfa 2: 2009-12 Biyoaerosoller ve biyolojik ajanlar; Çiftlik hayvancılığında emisyon kaynakları ve azaltıcı önlemler; Genel Bakış (Biyoaerosoller ve biyolojik ajanlar; Hayvancılık operasyonlarında emisyon kaynakları ve kontrol önlemleri; Genel Bakış). Beuth Verlag, Berlin. s. 11.
  31. ↑ a b c d e F. Grimont, PAD Grimont: The Genus Enterobacter. İnsanlarda Patojenite ile İlgili Özellikler, Biyoteknoloji. İçinde: Prokaryotlar. Bakteri Biyolojisi Üzerine Bir El Kitabı, Cilt 6. 2006, s. 203-204.
  32. ↑ L. Zhang, Y. Zhang, Q. Liu, L. Meng, M. Hu, M. Lv, K. Li, C. Gao, P. Xu, C. Ma: Metabolik olarak tasarlanmış Enterobacter cloacae ile diasetil üretimi. İçinde: Bilimsel Raporlar . Cilt 5, Mart 2015, sayfa 9033, doi : 10.1038 / srep09033 , PMID 25761989 , PMC 4357014 (serbest tam metin).
  33. ↑ a b c d e f Robert Koch Enstitüsü'ndeki (RKI) Hastane Hijyeni ve Enfeksiyon Önleme Komisyonunun (KRINKO) Tavsiyesi: Enfeksiyon veya çoklu dirençli gram-negatif çubuklarla kolonizasyon durumunda hijyen önlemleri. İçinde: Federal Sağlık Gazetesi - Sağlık Araştırması - Sağlığın Korunması. Cilt 55, 2012, sayfa 1311-1354, doi : 10.1007 / s00103-012-1549-5 .
  34. ↑ a b c d Yoğun bakım ünitelerinde edinilen sağlık hizmetiyle ilişkili enfeksiyonlar - 2016 için Yıllık Epidemiyolojik Rapor. (PDF; 962 KB) ECDC Gözetim Raporu. Avrupa Hastalık Önleme ve Kontrol Merkezi (ECDC), Mayıs 2018, sayfa 1–11 , erişim tarihi 24 Mayıs 2018 .
  35. ^ A b Hajo Grundmann, Corinna Glasner, Anna-Pelagia Magiorakos, Liselotte Högberg-Diaz, Dominique L. Monnet, Barbara Albiger: Avrupa'da karbapenemaz üreten bakteriler. (PDF; 3.3 MB) ECDC Teknik Raporu. Avrupa Hastalık Önleme ve Kontrol Merkezi (ECDC), Kasım 2013, s. 1–18 , erişim tarihi 24 Mayıs 2018 .
  36. ↑ Ashfaque Hossain, MJ Ferraro ve diğerleri: Plazmid Aracılı Karbapenem-Hidrolize Enzim KPC-2 bir Enterobacter sp. İçinde: Antimikrobiyal Ajanlar ve Kemoterapi . Cilt 48, No. 11, Kasım 2004, sayfa 4438-4440, doi : 10.1128 / AAC.48.11.4438-4440.2004 , PMID 15504876 , PMC 525415 (serbest tam metin).
  37. ↑ Marianne Abele-Horn: Antimikrobiyal Tedavi. Bulaşıcı hastalıkların tedavisi ve profilaksisi için karar desteği. Werner Heinz, Hartwig Klinker, Johann Schurz ve August Stich işbirliğiyle 2., gözden geçirilmiş ve genişletilmiş baskı. Peter Wiehl, Marburg 2009, ISBN 978-3-927219-14-4 , s. 262.
  38. ↑ Patrick NA Harris, Jane Y. Wei ve diğerleri: Enterobacter, Citrobacter veya Serratia türlerinin neden olduğu kan dolaşımı enfeksiyonlarının tedavisinde alternatif antibiyotiklere karşı karbapenemler: meta-analiz ile sistematik bir inceleme. İçinde: Antimikrobiyal Kemoterapi Dergisi . Cilt 71, Sayı 2, Şubat 2016, sayfa 296-306, doi : 10.1093 / jac / dkv346 , PMID 26542304 (inceleme).
  39. ↑ Robert Koch Enstitüsü (Ed.): Patojenler ve direnç için sürveyans sistemlerine genel bakış . 29 Ocak 2015, s. 1-3 ( Çevrimiçi + PDF, 141 KB [30 Mart 2018'de erişildi]).
  40. ↑ Robert Koch Enstitüsü Duyurusu: Hastane enfeksiyonlarının gözetimi ve özel dirençli ve çoklu dirençli patojenlerin kaydı. İçinde: Federal Sağlık Gazetesi - Sağlık Araştırması - Sağlığın Korunması. Cilt 56, 2013, sayfa 580-583, doi : 10.1007 / s00103-013-1705-6 .
  41. ↑ Susan L. Fraser, Christian P. Sinave: Enterobacter Enfeksiyonları. İçinde: Medscape. 5 Eylül 2017. Erişim tarihi: 24 Mayıs 2018 .

İnternet linkleri

Commons : Enterobacter  - resim, video ve ses dosyalarının toplanması
Vikitür : Enterobacter  Tür Dizini