enterobakterigiller

enterobakterigiller
Escherichia coli (ikincil elektron mikroskobu görüntüsü, daha sonra renkli)

Escherichia coli (ikincil elektron mikroskobu görüntüsü, daha sonra renkli)

sistematik
Etki alanı : Bakteriler (Bakteriler)
Departman : proteobakteriler
Sınıf : Gamaproteobakteriler
sipariş : Enterobakteriler (Enterobakteriler)
Aile : enterobakterigiller
Bilimsel ad
enterobakterigiller
Rahn 1937'de düzeltti. Adeoğlu et al. 2016

Enterobacteriaceae büyük bir grup olan gram-negatif bakteri . Göre filogenetik sistemine , ait oldukları sırayla arasında Enterobacterales içinde sınıfının arasında Gammaproteobacteria içinde bölünmesi ( Divisio , olarak da bilinen filum arasında prokaryotlar ) Proteobacteria ve kendi oluştururlar ailesini orada . Enterobacteriaceae adı enteron'dan ( eski Yunanca ἕντερον 'bağırsak') türetilmiştir , çünkü bunların çoğu tipiktir. Bağırsak sakinleridir . Bununla birlikte, birçok serbest yaşayan ve her yerde bulunan , kolonda yaşamayan bakteri türleri de bu aileye aittir.

2016 yılına kadar Enterobacteriaceae, "Enterobacteriales" takımındaki tek aileydi, ancak bu takımın adı bakteriyolojik kod (ICBN) kurallarına göre geçerli değildi. 2016 yılında, filogenetik yöntemler, daha önce bilinen taksonların birkaç yeni aileye bölünmesiyle birlikte Enterobacterales (Enterobacteria) takımının kurulmasına yol açtı . Yeni sistem , daha az cinsin Enterobacteriaceae familyasına ait olduğu ve Yersinia , Proteus veya Hafnia ile aynı düzenden bilinen cinslerin diğer familyalara ait olduğu anlamına gelir (bkz. Bölüm Sistematik ve Taksonomi ).

özellikleri

Görünüm

Hücreler olan çubuk şeklinde ve genellikle 1 ila 5  um uzunluğunda ve 0.5-1.0 um ile ilgili. Hiçbir endosporlarının edilir kurdu. Çoğu flagella ile aktif olarak hareket edebilirler , hareketlidirler , ancak aktif olarak hareket edemeyen türler de vardır, örn. B. Klebsiella ve Raoultella . Yana hücre duvarı birkaç oluşur murein tabakaları ve bir ikinci, dış membran arasında fosfolipidler ve lipopolisakkaritler , Enterobacteriaceae olan gram-negatif .

metabolizma

SIM agarda Raoultella planticola , H 2 S oluşumu için negatif bir sonuçla, indol testi için negatif bir sonuçla ve motilite için negatif bir sonuçla

Metabolizmaları fakültatif olarak anaerobiktir , bu nedenle oksijen varlığında oksidasyon yoluyla maddeleri parçalayabilir ve anoksik koşullar altında (oksijen yok) fermente edebilirler . Enterobacteriaceae'de katalaz testi pozitif, oksidaz testi negatiftir. Bireysel türleri ayırt etmek için kullanılan iki önemli anaerobik metabolik yol, 2,3-bütandiol fermantasyonu ve karışık asit fermantasyonudur ( karışık asit fermantasyonu ). Karışık asit fermentasyonunda, nihai ürünler ve yan ürünler esas olarak asetik asit , laktik asit ve süksinik asit (süksinat) gibi asitlerdir , ancak bütandiol yoktur . 2,3-bütandiol fermantasyonunda, glikozun fermantasyonu, son ürünler ve yan ürünler olarak daha az miktarda asitle, ancak hepsinden öte, büyük miktarlarda alkol 2,3-bütandiol ile sonuçlanır . 2,3-bütandiol, fermantasyon bir başka özelliği, ara ürün asetoin ve çok daha yüksek gaz üretimi ( CO 2 ). Bütandiol fermantasyonu z bulunur. B. Enterobacter ve Klebsiella . Diğer şeylerin yanı sıra karışık asit fermantasyonu kullanın. Citrobacter , Escherichia , Salmonella ve Shigella gibi cinsler .

Bireysel cinsleri belirlemek için çok sayıda biyokimyasal tanı testi kullanılır. Örneğin, 2,3-bütandiol fermantasyonunun ara ürün asetoini , Voges-Proskauer testi yardımıyla tespit edilir . Bu reaksiyon, Escherichia'yı diğer Enterobacteriaceae'den ayırt etmek için sözde IMViC test prosedürünün bir parçasıdır . Renkli reaksiyon ürünleri genellikle test prosedüründe üretildiğinden veya renk değişimine sahip pH indikatörleri kullanıldığından, laboratuvarda renkli seriler olarak anılırlar . β-galaktosidaz enziminin tespiti de genellikle Enterobacteriaceae temsilcilerini ayırt etmek için kullanılır. Bu enzime sahip bakteriler, hidrolitik olarak disakkarit laktozu (süt şekeri) metabolizmada kullanmak üzere monosakkaritler olan glukoz ve galaktoza parçalayabilirler.

filogenetik

→ Ayrıca bakınız: Enterobacterales siparişinin makalesindeki Sistematik ve Taksonomi Bölümü

Filogenetik yöntemler kullanılarak kabile tarihi ve bakteriler arasındaki ilişkiler netleştirilebilir. Sipariş açıklamasında Enterobacterales Adeolu ve ark. 2016 ve buna ait ailelerde, Enterobacteriaceae oluşturan bir monofiletik grubu , bir de filogenetik ağacı (temel genom ve genetik analizler ) . Ayrıca, 21, korunmuş karakteristik indeller (İng. ' Conserved imza ekleri ve silinmeleri CSI) seti, ailenin temsilcilerine özgüdür, ancak takımın diğer bakterilerinde oluşmaz.

oluşum

Birçok Enterobacteriaceae, insan ve hayvanların sağlıklı bağırsak florasının bir parçasıdır ; ancak çevrenin her yerinde (toprak, su) da bulunurlar. Bazıları insanlarda ve hayvanlarda patojendir. Genellikle hastane patojenleri ("hastane mikropları") olarak ortaya çıkarlar ve bağışıklık sistemi zayıf olan insanlara saldırırlar . Ailenin muhtemelen en önemli üyesi, genetik , biyokimya ve mikrobiyoloji alanındaki en önemli model organizmalardan biri olan Escherichia coli'dir .

Sistematik ve taksonomi

Harici sistem

2016 yılında kurulan Enterobacterales takımı , toplamda yaklaşık 60 cinse sahip sekiz aileyi ( Hafniaceae , Morganellaceae ve Yersiniaceae dahil ) içerir. Bakteriyolojik kodun (ICBN) kurallarına karşılık gelen düzenin yeni kurulan tür cinsi Enterobacter cinsidir .

Dahili sistem

Gram boyamadan sonra Citrobacter freundii'nin ışık mikroskobik resmi

Tipi cinsi ailesinin cinstir Escherichia cinsi iken, Enterobacter kuruldu sipariş Enterobacterales türü cinsi olarak. Aşağıdaki cinsler Enterobacteriaceae ailesine aittir (2019 itibariyle):

Koloniler, bir Cronobacter sakazakii'nin bir ilgili besleyici ortam
H 2 S oluşumu için pozitif sonuçlar veren XLD agar üzerinde Salmonella kolonileri

Eşanlamlılar ve güvenilir şekilde atanmamış taksonlar

Tüm türler arasından Levinea Young ve diğ. 1971'de Werkman ve Gillen , 1932'de Citrobacter cinsine eklendi . Calymmatobacterium granulomatis türü 1999 yılında Klebsiella granulomatis olarak yeniden sınıflandırılmıştır.

"Atlantibacter", "Edaphovirga", "Kosakonia", "Lelliottia", "Limnobaculum", "Pluralibacter", "Pseudocitrobacter", "Rosenbergiella", "Siccibacter" ve "Superficieibacter" isimleri (henüz) mevcut olmayan diğer cinslerdir. Bakteriyolojik Kod (ICBN) (2019 itibariyle) kurallarına göre tanınır ve ailenin bir parçası olduklarından şüphelenilir. Aileye ait sayılabilecek Candidatus statüsüne sahip başka cins veya türler de vardır . Bunlar örneğin " Candidatus Arocatia carayoni", " Candidatus Ishikawaella capsulata" ve " Candidatus Schneideria nysicola"dır.

etimoloji

Cinsinin adı Enterobacter Hormaeche ve Edwards 1960 türetilmiştir bağırsak ( Antik Yunan ἕντερον 'bağırsak') ve Latinized kelime BACTER için antik Yunan βακτηρΐα dolayısıyla gelir, 'çubuk' gibi bir şey "barsakta küçük çubuk bakteri". Enterobacteriaceae Rahn 1937 ailesinin adı aynı kelime köklerini içerir, ancak adın kökeni, onu tanımlayan ilk kişi olarak Rahn tarafından kesin olarak aktarılmamıştır. Tanımlandığı sırada Enterobacter cinsinin bakterileri henüz bu isimle adlandırılmamıştı. İlk baskısında Bergey en Sistematik Bakteriyoloji El Kitabı 1984 den, etimoloji şu şekildedir: sunulmuştur Latinized kelime enterobacterium demektir 'bağırsak bakteri' bağırsak bakterileri, adı Enterobacteriaceae aracı “aile bir aileyi tespit etmek -aceae biten tipik ile, ”. Bu türetme, adın neden Enterobacteriaceae (ek bir "i" ile) olduğunu ve Enterobacteraceae olmadığını açıklayacaktır.

Raporlama gereksinimi

İsviçre'de, pozitif laboratuvar analitik bulgu karbapenemazın görsel Enterobacteriaceae raporlama gereksinimlerini yani sonra doktorlar, hastaneler, vb veya laboratuvarlarda için Salgın Hastalıklar Yasası ile bağlantılı olarak (EPG) epidemik Yönetmelik ve Ek 1 ve Ek 3 arasında Düzenlenmesi EDI üzerinde insanlarda bulaşıcı hastalıklar gözlemlerinin raporlanması .

Ayrıca bakınız

kabarma

Edebiyat

Bireysel kanıt

  1. ↑ a b c d e M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, RS Gupta: 'Enterobacteriales'in genom tabanlı filogenisi ve taksonomisi: Enterobacterales ord. kasım Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam familyalarına ayrılmıştır. Kasım, Pectobacteriaceae familyası. Kasım, Yersiniaceae fam. Kasım, Hafniaceae familyası. Kasım, Morganellaceae fam. Kasım ve Budviciaceae fam. kasım İçinde: Uluslararası Sistematik ve Evrimsel Mikrobiyoloji Dergisi. Hayır. 66 , Aralık 2016, s. 5575-5599 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001485 .
  2. ↑ a b Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock Mikrobiologie. Almanca çeviri Werner Goebel tarafından düzenlendi, 1. baskı. Spektrum Akademischer Verlag GmbH, Heidelberg / Berlin 2000, ISBN 3-8274-0566-1 , s. 531-536.
  3. ^ A b Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Alanların ve filumların sınıflandırılması - Prokaryotların (bakteriler) hiyerarşik sınıflandırması. İçinde: İsimlendirmede Duran (LPSN) olan Prokaryotik isimlerin listesi . 21 Aralık 2019'da alındı .
  4. ↑ Taksonomi Tarayıcı Enterobacteriaceae. İçinde: Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) web sitesi . 21 Aralık 2019'da alındı .
  5. ↑ E. Hormaeche, PR Edwards: Önerilen bir Enterobacter cinsi. İçinde: Uluslararası Bakteriyolojik Adlandırma ve Taksonomi Bülteni. Cilt 10, Sayı 2, Nisan 1960, sayfa 71-74. ISSN  0096-266X . doi : 10.1099/0096266X-10-2-71 .
  6. ^ Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Cins Enterobacter. İçinde: Adlandırmada Duran Prokaryotik İsimlerin Listesi, Bakterilerin Sistematiği (LPSN) . 21 Aralık 2019'da alındı .
  7. ^ Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Aile Enterobacteriaceae. İçinde: Adlandırmada Duran Prokaryotik İsimlerin Listesi, Bakterilerin Sistematiği (LPSN) . 21 Aralık 2019'da alındı .

İnternet linkleri

Commons : Enterobacteriaceae  - resim, video ve ses dosyalarının toplanması
Vikitür : Enterobacteriaceae  - Tür Dizini