Proteobakteriler
Proteobakteriler | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Citrobacter freundii (ikincil elektron mikroskobu görüntüsü) | ||||||
sistematik | ||||||
| ||||||
Bilimsel ad | ||||||
Proteobakteriler | ||||||
Garrity vd. 2005 |
Proteobakteri büyük birini temsil gruplar alan bir bakteri olan, kabul şekilde bölümler veya suşlar (anlamında filum ) . Birçok önemli içerir azot bağlayıcı bakteri ve patojen.
Proteobacteria adı , şeklini değiştirebilen Yunan tanrısı Proteus'tan türemiştir ve bu gruptaki çeşitli şekillere atıfta bulunur. Bu nedenle morfolojik olarak değildir, ancak ilgili RNA dizileri tarafından tanımlanır . Proteobacteria'nın hücre duvarları özellikle tek katmanlı murein ve lipopolisakkaritlerden oluşur , bu yüzden gram negatiftirler . Bununla birlikte, bazı türler de gram değişkenine tepki verir. B. Azospirillum brasilense ve türleri Methylobacterium . Birçok türün kamçı vardır , diğerleri kayabilir.
Rhodospirillaceae ( mor bakteri ) ve Chromatiaceae (kükürt moru bakteri) gibi bazı alt gruplar, anoksik koşullar altında anoksijenik fotosentez gerçekleştirebilirler. Elektron vericisi olarak organik maddeler, hidrojen sülfür , kükürt veya hidrojen kullanırlar ve bu nedenle herhangi bir elementel oksijen üretmezler .
Myxobacteria alt grubu, tek hücreli ve çok hücreli yaşam arasındaki geçiş alanında şimdiye kadar bilinen tek proteobakteri grubudur. Miksobakteriler , cıvık mantarlara bir yakınsama olan sporlarla çok hücreli meyve veren vücutlar oluşturur .
Proteobakteri başlangıçta edildi beş ana grupta, ayrıldı inceledi bir şekilde sınıfa ve önek olarak Epsilon Yunan harfleri Alfa verildi: Alfaproteobacteria , Betaproteobacteria , Gammaproteobacteria , Deltaproteobacteria ve Epsilonproteobacteria . Zamanla (2020 itibariyle), " Zetaproteobacteria ", Acidithiobacillia , Hydrogenophilalia ve Oligoflexia olmak üzere dört başka sınıf tanımlanmıştır .
Mitokondri ökaryotlar , hücre çekirdeği olan tüm canlıların, muhtemelen kaynaklanan Endosimbiyotik proteobakteriyle ( : bakınız Endosimbiyotik hipotezi ).
sistematik
Sekiz proteobakteri sınıfının bazı önemli takımları, aileleri ve cinsleri aşağıda listelenmiştir. Makale Bakterilerin sistematiği olan bir referans içinde Wikipedia ve daha büyük bir seçim içeren taksa Phylum Proteobacteria içinde.
Acidithiobacillia
-
- Sipariş I. Acidithiobacillales
-
- Aile Acidithiobacillaceae
- Cins Acidithiobacillus
- Thermithiobacillaceae ailesi
- Cins Thermithiobacillus
-
-
Alfaproteobakteriler
-
- Sipariş I.Rodospirillales
- Aile I. Rhodospirillaceae (kükürt içermeyen işleme mor bakteriler)
- Aile II Acetobacteraceae ; triv. Asetik asit bakterileri ( sirke )
- Sipariş II. Rickettsiales
- Sipariş VI. Rhizobiales
-
- Aile I. Rhizobiaceae
- Cins I. Rhizobium
- Aile II. Bartonellaceae
- Aile III. Brucellaceae
-
-
- ve diğer taksonlar
Betaproteobacteria
-
- Sipariş I. Burkholderiales
- Sipariş IV. Neisseriales
-
- Aile I. Neisseriaceae
-
-
- ve diğer taksonlar
Gammaproteobacteria
-
- Sipariş I. Chromatiales
- Aile I. Chromatiaceae (triv. Kükürt-mor bakteri)
- Aile II. Ectothiorhodospiraceae
- Sipariş II. "Xanthomonadales"
-
- Aile I. " Xanthomonadaceae "
- Cins I. Xanthomonas
- Cins VII. Stenotrophomonas
-
-
Bakteriyel sistematiğin önemli bir listesi olan LPSN'de ( İsimlendirmede Duran Prokaryotik isimlerin listesi), Xanthomonadales sırası artık listelenmemektedir. Bu sipariş ve teslim edilen tek Xanthomonadaceae ailesi, son araştırmalar nedeniyle feshedildi. Cinslerin çoğu artık Lysobacterales sırasına atanmıştır , diğerleri henüz herhangi bir özel siparişe atanmamıştır. Ancak eski sistem hala kullanılıyor. B. NCBI'nin ( Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi ) taksonomi veritabanında , bakteriler hakkında önemli bir bilgi kaynağı olan hala kullanılmaktadır.
-
- Sipariş IV. Thiotrichales
-
- Aile I. Thiotrichaceae
- Cins VII. Thiomargarita
-
- Sipariş VIII. Pseudomonales
-
- Aile I.Pseudomonaceae
- Cins I. Pseudomonas
- Aile II. Moraxellaceae
- Cins I. Moraxella
- Cins II. Acinetobacter
-
- Sipariş X. " Vibrionales "
-
- Aile I. Vibrionaceae
- Cins I. Vibrio
-
- Sipariş XII. Enterobacterales , daha önce sipariş "Enterobacteriales" olarak anılacaktır
- Budviciaceae ailesi
- Enterobacteriaceae ailesi
- Erwiniaceae ailesi
- Hafniaceae ailesi
- Morganellaceae ailesi
- Pectobacteriaceae ailesi
- Thorselliaceae ailesi
- Yersiniaceae ailesi
- Sipariş XIII. Pastöreliler
-
- Aile I.Pasteurellaceae
- Cins I. Pasteurella
- Cins III. hemofili
-
- Sipariş XIV. Oceanospirillales
-
- Aile I.Alcanivoracaceae
- Aile II. Hahellaceae
- Aile III. Halomonadaceae
- Cins I. Halomonas
- Aile IV. Litoricolaceae
- Aile V. Oceanospirillacae
- Aile VI. Oleiphilaceae
- Aile VII. " Saccharospirillaceae "
-
-
- ve diğer taksonlar
Hidrojenofilik
-
- Sipariş I. Hydrogenophilales
- Hydrogenophilaceae ailesi
-
- sadece bir cins olan Hydrogenophilus
Deltaproteobakteriler
-
- Sipariş I. Desulfovibrionales
-
- Aile I. Desulfovibrionaceae
- Cins Desulfovibrio
-
- Sipariş II. Myxococcales (Myxobacteria)
- Myxococcaceae ailesi
- Sipariş Bdellovibrionales
-
- Aile Bdellovibrionaceae
- Cins Bdellovibrio
-
-
- ve diğer taksonlar
Epsilonproteobakteriler
-
- Campylobacterales sipariş edin
-
- Aile Campylobacteraceae
- Cins Campylobacter
- Aile Helicobacteraceae
- Cins Helicobacter
-
- Sipariş Nautiliales
-
- Aile Nautiliaceae
- Cins Nautilia
-
-
- ve diğer taksonlar
Oligofleksi
-
- Sipariş I. Oligoflexales
-
- Oligoflexaceae ailesi
- Cins oligoflexus
-
- Sipariş II. Silvanigrellales
-
- Silvanigrellalaceae
- Cins Silvanigrella
-
-
" Zetaproteobacteria "
- Tek cins Mariprofundus ile "Mariprofundaceae" familyası
kabarma
Edebiyat
- Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Eds.): The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria . 7 cilt, 3. baskı, Springer-Verlag, New York ve diğerleri O., 2006, ISBN 0-387-30740-0 . Cilt 5: Proteobacteria: Alfa ve Beta Alt Sınıfı ISBN 0-387-30745-1 ; Cilt 6: Proteobacteria: Gamma Alt Sınıfı ISBN 0-387-30746-X ; Cilt 7: Proteobacteria: Delta and Epsilon Subclass , ISBN 0-387-30747-8
- George M. Garrity , Don J. Brenner , Noel R. Krieg, James T. Staley (Eds.): Bergey'nin Sistematik Bakteriyoloji El Kitabı: Cilt 2: Proteobakteriler, Kısım B: Gammaproteobacteria . 2. Baskı. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-95040-2 , doi : 10.1007 / 0-387-28022-7 .
- George M. Garrity, Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley (Eds.): Bergey'in Sistematik Bakteriyoloji El Kitabı: Cilt 2: Proteobakteriler, Bölüm C: Alfa-, Beta-, Delta- ve Epsilonproteobacteria . 2. Baskı. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-24145-6 , doi : 10.1007 / 0-387-29298-5 .
Bireysel kanıt
- ↑ a b Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Alanların ve filumların sınıflandırılması - Prokaryotların (bakterilerin) hiyerarşik sınıflandırması. In: Standing in Nomenclature (LPSN) ile Prokaryotik isimlerin listesi . Erişim tarihi: December 20, 2019 .
- ↑ KP Williams, DP Kelly: Proteobacteria filum, Acidithiobacillia classis nov., Acidithiobacillales tip düzeni ve Gammaproteobacteria sınıfının değiştirilmiş açıklaması içinde yeni bir sınıf önerisi . In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Hayır. 63 , Ağustos 2013, s. 2901-2906 , doi : 10.1099 / ijs.0.049270-0 .
- ^ BJ Tindall: Solimonadaceae Losey ve ark. 2013 meşru değil, 'Sinobacter soli' tarağı adlarını oluşturma önerileri. kas. ve 'Sinobacter variicoloris' Kod'a aykırıdır, Xanthomonadaceae Saddler ve Bradbury 2005 aile adı ve Xanthomonadales Saddler ve Bradbury 2005 sipariş adı yasal değildir ve Solibacteraceae Zhou ve diğerleri aile adlarının uygulanmasına ilişkin notlar. 2008, Nevskiaceae Henrici ve Johnson 1935 (Onaylı Listeler 1980) ve Lysobacteraceae Christensen ve Cook 1978 (Onaylanmış Listeler 1980) ve sipariş adı Lysobacteriales Christensen ve Cook 1978 (Onaylı Listeler 1980) karşılık gelen tür cinslerinin sınıflandırmasına göre Solibacter Zhou ve diğerleri . 2008, Nevskia Famintzin 1892 (Onaylı Listeler 1980) ve Lysobacter Christensen ve Cook 1978 (Onaylanmış Listeler 1980) ve bir taksonomik ad, yazarları ve ilgili açıklama / sınırlama / düzeltme arasındaki bağlantıyı doğru bir şekilde ifade etmenin önemi : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB) Cilt 64, sayfa 293-297. DOI: 10.1099 / ijs.0.057158-0
- ↑ M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, RS Gupta: 'Enterobacteriales'in genom temelli filogeni ve taksonomisi: Enterobakteriler için öneri ord. kas. Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam ailelerine ayrılır. kas., Pectobacteriaceae fam. kasım, Yersiniaceae fam. kasım, Hafniaceae fam. Kasım, Morganellaceae fam. nov. ve Budviciaceae fam. kas. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Hayır. 66 , Aralık 2016, s. 5575-5599 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001485 .
- ↑ R. Nakai, M. Nishijima, N. Tazato, Y. Handa, F. Karray, S. Sayadi, H. Isoda, T. Naganuma: Oligoflexus tunisiensis gen Kasım, Sp. nov., yeni bir proteobakteriyel soyun Gram-negatif, aerobik, filamentli bir bakteri ve Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. kas. ve Oligoflexia classis nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Hayır. 64 , Ekim 2014, s. 3353-3359 , doi : 10.1099 / ijs.0.060798-0 .
- ↑ Martin W. Hahn, Johanna Schmidt, Ulrike Koll, Manfred Rohde, Susanne Verbarg, Alexandra Pitt, Ryosuke Nakai, Takeshi Naganuma, Elke Lang: Silvanigrella aquatica gen Kasım, Sp. Kasım, bir tatlı su gölünden izole edilmiş, Silvanigrellaceae fam. kas. ve Silvanigrellales ord. Kasım, Bdellovibrionales sırasının Oligoflexia sınıfında yeniden sınıflandırılması, Bacteriovoracaceae ve Halobacteriovoraceae familyalarının yeni Bacteriovoracales ord sırasına göre yeniden sınıflandırılması. Nov., ve Pseudobacteriovoracaceae familyasının Oligoflexales sırasına göre yeniden sınıflandırılması . In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . Hayır. 67 , Ağustos 2017, s. 2555-2568 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001965 .
- ↑ David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan, Craig L. Moyer, Anna-Louise Reysenbach: Marine Fe-Oxidizing Microbial Mat Oluşumunda Yer Alan Yeni Bir Proteobacteria Soyu Topluluklar . İçinde: PLoS ONE . bant 2 , hayır. 8 , Ağustos 2007, s. e667 , doi : 10.1371 / journal.pone.0000667 .
İnternet linkleri
- Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Alanların ve filumların sınıflandırılması - Prokaryotların (bakterilerin) hiyerarşik sınıflandırması. In: Standing in Nomenclature (LPSN) ile Prokaryotik isimlerin listesi . Erişim tarihi: December 20, 2019 .
- Hayat Ağacı Web Projesi - Proteobacteria