Pegasoferae

Pegasoferae bir olan varsayımsal takson olan memelilerde edildi (Mammalia), teklif edilen ilk defa ile Haziran 2006'da Hidenori Nishihara , Masami Hasegawa ve Norihiro Okada bir temelinde moleküler biyolojik analizi. Bu oluşan bir gruptur ferae ( yırtıcı ve pangolins ), tek toynaklı (Perissodactyla) ve bitler ortak sistematik grubunda (ordosu). Bu nedenle içerir alternatif hipotezi Fereuungulata , hemen akla yatkın yukarı olarak kabul edilmiştir , ile Ferae ve tek parmaklı toynaklı kombinasyonu Cetartiodactyla ( çift parmaklı toynaklı ve balina ).

Dikkate alınan hayvan gruplarının kısa açıklaması

Pegasoferae içinde birleşen hayvan gruplarının çok farklı yaşam biçimleri ve özelliklerinin kombinasyonları nedeniyle, genel olarak geçerli bir özellik açıklaması mümkün değildir, kombinasyon yalnızca genetik materyaldeki benzerliklere dayanmaktadır. Aşağıda, kardeş gruplar olarak kabul edilen incelenen taksonlar ve setartiodactyla kısaca tanımlanmış olup, ilgili makalelerde ayrıntılı bir açıklama bulunabilir:

Ferae

Ferae türe zayıf gruptan oluşur pangolins (Pholidota) ve şekil açısından zengin yırtıcı (Etçiller). Foklar haricinde , bunlar dünya çapında yaygın olan ve çoğunlukla yırtıcı bir yaşam biçiminde uzmanlaşmış dört ayaklı kara hayvanlarıdır (örneğin, dev panda bir istisnadır ). Pangolinler, oldukça özelleşmiş karınca ve termit yiyicilerdir, avcıların çoğu etobur ve balık yiyicilerdir. Sıralama olarak listelenen bu iki hayvan grubu arasındaki ilişki, büyük ölçüde doğrulanmış olsa da, pangolinler de sıklıkla ikincil hayvanların ilişkilerinde sınıflandırılır .

Tek parmaklı toynaklılar

Eşleşmemiş toynaklı (Perissodactyla) büyük otçul grubudur. Özellikle atlar , bozkır manzaralarına uyum sağlamış, oldukça uzmanlaşmış koşuculardır. Tapirler ve gergedanlar da bu gruba aittir . Tüm eşlenmemiş toynaklıların karakteristik bir özelliği olarak, hem ön hem de arka ayakların ana ekseni merkezi ışın boyunca ilerler, üçüncü ayak buna göre tüm türlerde en büyüğüdür.

Yarasalar

Yarasalar aktif uçabilen sadece memeli. Bu yaşam tarzının gereksinimlerine göre, ekstremiteleri modifiye edilir ve bir uçuş membranı ile donatılmıştır. Kısmen böceklerle ( yarasalar ) ve kısmen meyvelerle ( uçan tilkiler ) beslenirler . Kemirgenlerden sonra , tür bakımından en zengin memelileri temsil ederler.

Cetartiodactyla

Cetartiodactyla oluşur çift parmaklı toynaklı (Artiodactyla) ve balina hem morfolojik ve moleküler biyolojik özellikleri ile monofiletik takson oluşturmak üzere birleştirilir (Cetacea'lara). Tomurcuklar, devam eden bir yaşam tarzına adaptasyon nedeniyle ayak parmaklarının toynaklara dönüştüğü, ancak bir bacağın merkezi ekseninin üçüncü ve dördüncü ayak parmağı arasında uzandığı garip toynaklılar gibi büyük, dört ayaklı otçullardır. Balinalar ise denizdeki yaşama tamamen uyum sağlamış bir grup hayvanı ( deniz memelileri ) temsil eder. Bu grup hem avlanan etoburları ( balık, ahtapot, memeliler ve diğer deniz hayvanları ile beslenen dişli balinalar ) hem de plankton filtreli besleyicileri ( balina balinaları ) içerir. Balinaların eserlerin akrabaları olarak gruplandırılması, esas olarak paleontolojik buluntular temelinde gerçekleşir, eserlerde su aygırları balinaların en yakın akrabalarıdır.

yöntem

Arka plan: kullanılan genetik öğelerin yapısı ve işlevi

Pegasoferae derlemesinin bir temeli olarak, memelilerdeki tüm takımların temsilcilerinin sözde retropozonlar olarak adlandırılan genomun kısa bölümleri karşılaştırıldı ve değerlendirildi. Retropozonlar , genomda bulunan ve yalnızca ters transkripsiyon yardımı ile kopyalanabilmeleri ile karakterize edilen özel bir transpozon (atlama genleri) formudur . Şimdiye kadar, genoma entegre olduktan sonra bir retropozonun çıkarılmasına ( tersine çevrilmesine ) neden olabilecek hiçbir mekanizma bilinmemektedir . Ek olarak, bir genom içinde aynı lokasyonda homolog bir retropozonun çoklu bağımsız birleşmesi ( yerleştirilmesi ), farklı hayvan gruplarında göz ardı edilir. Bu nedenle, retropozonlar duyarlı değildir homoplasia veya yakınlaşmaları , diğer bir deyişle , bağımsız bir şekilde birkaç kez geliştirildi, ve yüksek bilgi değeri ile filogenetik çalışmalar yapılabilir üzerinde genomu içinde sabit bir elemanı temsil olan özellikleri.

Nishihara ve ark. idi uzun serpiştirilmiş nükleer elemanlar L1 temsilcilerine memelilerin tüm siparişler kullanılan tipte (HAT). L1 elementleri, araştırılan en iyi retropozonlar arasındadır ve insanlarda toplam genomun yaklaşık% 16'sını oluşturur. Baz eşleşmeleri ve özellikle nükleotidlerin sözde 3 'ucundaki dizilişleri nedeniyle 50'den fazla farklı türe ayrılırlar . Ayrıca uzunlukları da farklıdır ve ortalama altı kbp (6000 baz çifti) civarındadır, ancak birkaç yüz baz çifti kadar değişebilir. Varyasyon, elementlerin genoma dahil edilmesi sırasında DNA'nın replikasyonundaki kırılmalara atfedilir . Bireysel L1 elementleri aslında yapıları ve genomdaki konumları bakımından benzersiz olduklarından, homoplazi tamamen dışlanır.

Retroposonların seçimi ve karşılaştırılması

Memelilerdeki filogenetik ilişkileri göstermek için , pangolinler hariç tüm memeli takımlarının temsilcilerinin genom dizileri birbirleriyle karşılaştırıldı ( hizalama ) ve en makul sonuç önyükleme yöntemi kullanılarak elde edildi. Çalışma grubu, açıklanan L1 elementleri üzerinde yoğunlaştı ve ev faresi ( Homo sapiens ) olan insanların halihazırda bilinen gen dizilerini ( Homo sapiens ) karşılaştırırken daha önce in silico taramasında yaptıkları toplam 192 lokusu ( gen lokasyonu) birbiriyle karşılaştırdı. Mus musculus ), evcil köpek ( Canis lupusiliaris ) ve evcil sığır ( Bos taurus taurus ).

Bunlardan 44 lokus tanındı ve siparişler düzeyinde filogenetik bir ilişkinin kanıtı olarak kullanıldı.

Sonuç

Nishihara ve ark. 2006'da geliştirilen hipotez, Afrotheria , Xenarthra , Euarchontoglires ve Laurasiatheria ile yüksek memelilerdeki genel büyük sistematiği doğrulamaktadır . Çalışmalar ayrıca skrotifera taksonunu da desteklemektedir . Bunun içinde, ancak, bunların sonuçları takson ters Fereuungulata , şimdiye kadar makul olarak kabul edilmiştir ki, bitler gruplandırılır tek toynaklı ve ferae (bir kardeş grubu olarak Zooamata ) yerine Cetartiodactyla arasında ve bu form ile takson Pegasoferae. Cetartiodactyla, Pegasoferae'nin kardeş grubu olarak kabul edilir:

Laurasiatheria	Scrotifera    Cetartiodactyla (eserler ve balinalar)   Pegasoferae    Yarasalar (chiroptera)   Zooamata    Tek parmaklı toynaklılar      Ferae (avcılar ve pangolinler)      Böcek yiyen (Eulipotyphla)

Tek parmaklı toynaklıların, çift parmaklı toynaklıların ve balinaların bir takson oluşturduğu klasik sistematiğinde çoğu kez hala bulunabilen Euungulata'nın gruplanması tamamen reddedildi . Grubu tırnaklı hayvanlara siparişleri ek olarak yukarıda bahsedilen (Ungulata) , de ihtiva söylenir aardvark , filler , manatees ve hyrax de hariç tutulmuştur morfolojik özellikleri üzerinde sadece dayanmaktadır ve.

Ayrıca yarasalar yerleşim ile birlikte morfolojik özelliklere dayalı araştırmalar, hangi desteklenmez onları sınıflandırmak ilişkisinde primatlar , dev planörlerle ve shrews ve böylece de Archonta yerine Laurasiatheria arasında. Bu moleküler temelde doğrulanamaz; Burada bitler Fereuungulata kardeş grup ya da bir kardeş grubu olarak ya kabul edilmiştir böcek yiyen daha sonra ortak takson oluşturan ile (Eulipotyphla), Insectiphillia .

Morfolojik ve paleontolojik bulgular

Morfolojik bir temelde, memelilerdeki moleküler genetik analizlere dayalı olarak oluşturulmuş tüm taksonlar, ancak büyük zorluklarla doğrulanabilir veya hiç doğrulanamaz. Özellikle Pegasoferae'nin yerleştiği Laurasiatheria'da morfolojik gözlem moleküler biyoloji bilgisiyle çelişiyor. Klasik olarak gruplandırılmış iki toynaklı (ungulata), toynaklılar ve toynaklar, bir sınıflandırma sorunu oluşturur . Her ikisi de artık yakınsak olduğu düşünülen bir dizi ortak özelliği paylaşır . Bu, her şeyden önce, dört uzuvda, özellikle parmak ve ayak parmağı ışınlarında bir azalma ve adaptasyon fenomeni olarak toynakların gelişimini içerir .

Moleküler-biyolojik keşif, paleontolojik olarak da desteklenemez, çünkü erken memeli evrimi çeşitli memeli formlarının hızlı bir şekilde yayılmasına yol açtı . Farklı memeli takımlarının ilk temsilcileri erkenden bulunabilir, ancak ara geçiş formları çok nadiren bulunur. Bu erken buluntuları Cetartiodactyla, hariç Laurasiatheria içindeki tüm gruplar için geçerlidir balina kardeş grubu olarak kesin bir atama izin toynaklı .

Adlandırma

Pegasoferae adı , yırtıcı ve pangolinden oluşan takson için önceden kurulmuş olan Ferae ( Latince : vahşi hayvanlar) isminden ve Pegaso- kök kelimesinden oluşur. Pegasoferae'nin diğer iki grubu uçan yarasalar ve atların en büyük payı oluşturduğu tek parmaklı toynaklılar olduğu için Yunan mitolojisinden Pegasus'a atıfta bulunur . Masami Hasegawa'nın önerdiği uçan bir at.

Edebiyat

Metin esasen yayına dayanmaktadır

• Hidenori Nishihara, Masami Hasegawa, Norihiro Okada: Pegasoferae, antik retropozon eklemelerini takip ederek ortaya çıkan beklenmedik bir memeli nesli. In: Ulusal Bilimler Akademisi Tutanakları . 103, 2006, s. 9929–9934 ( tam metin, PDF mevcuttur )

Metodolojik kısım ve taksonomik sunum için aşağıdaki kaynaklar da kullanılmıştır:

• PD Waddell, Y. Cao, J. Hauf, M.Hasegawa: Amino asit değişmez siteleri LogDet artı site sıyırma dahil olmak üzere memeli mtDNA'sını değerlendirmek için yeni filogenetik yöntemlerin kullanılması, kirpi konumlarına özel referansla verilerdeki iç çatışmaları tespit etmek için , armadillo, fil için. In: Sistematik Biyoloji . 48, 1999, sayfa 31-53.
• William J. Murphy, Eduardo Eizirik, Stephen J. O'Brien, Ole Madsen, Mark Scally, Christopher J. Douady, Emma Teeling, Oliver A. Ryder. Michael J. Stanhope, Wilfried W. de Jong, Mark S. Springer: Bayes Filogenetiği Kullanılarak Erken Plasental Memeli Radyasyonunun Çözümü. İçinde: Bilim . 294, 2001, s. 2348-2351.
• Jeheskel Shoshani, Malcolm C. McKenna: Moleküler verilerden elde edilen sonuçların seçilmiş karşılaştırmaları ile morfolojiye dayalı olarak mevcut memeliler arasında daha yüksek taksonomik ilişkiler. İçinde: Moleküler Filogenetik ve Evrim . 9 (3), 2001, s. 572-584.
• DE Pumo, PS Finamore, WR Franek, CJ Phillips, S. Tarzami, D. Balzarano: Artibeus jamaicensis adlı meyve yarasasının tam mitokondriyal genomu . ve yarasaların diğer Eutherian memelilerle ilişkilerine dair yeni bir hipotez. In: Journal of Molecular Evolution . 47 (6), 1998, s. 709-717.
• Malcolm C. McKenna, Susan K. Bell: Memelilerin Sınıflandırılması: Tür Seviyesinin Üstü . Columbia University Press, New York 1997, ISBN 0-231-11013-8 .
• Michael J. Novacek: Memeli fitojeni: ağacı sallamak. İçinde: Doğa . 356, 1992, s. 121-125.
• Michael J. Novacek: Memeli soyoluşu: Genler ve süper ağaçlar. In: Güncel Biyoloji . 11 (14), 2001; Sayfalar R573-R575
• Suzette K. Mouchaty, Anette Gullberg, Axel Janke, Ulfur Arnason: Tam Mitokondriyal Dizilerin Analizine Dayalı Eutheria İçerisindeki Talpidae'nin Filogenetik Konumu. In: Moleküler Biyoloji ve Evrim . 17, 2000, s. 60-67.
• Masato Nikaido, Fumio Matsuno, Healy Hamilton, Robert L. Brownell Jr. Ying Caodagger Wang Ding, Zhu Zuoyan Andrew M. Shedlock, R. Ewan Fordyce, Masami Hasegawa, Norihiro Okada: majör cetacean soyların retroposon analizi: monofili dişli balinalar ve nehir yunusları. In: Ulusal Bilimler Akademisi Tutanakları . 98, 2001, s. 7384-7389. ( Tam metin, PDF )

Bireysel kanıt

1. ↑ Murphy ve ark. 2001.
2. ↑ Waddell ve ark. 1999.
3. ↑ Murphy ve ark. 2001.
4. ↑ Shoshani & McKenna 2001, McKenna & Bell 1997.
5. ^ Novacek 1992, Shoshani & McKenna 2001, McKenna & Bell 1997.
6. ↑ Pumo vd. 1998, Novacek 2001, Murphy ve diğerleri. 2004.
7. ↑ Mouchaty ve diğerleri. 2000, Nikaido vd. 2001.