kodojenik iplik

Kodojenik zincir , transkripsiyon sırasında tek bir RNA zinciri oluşturmak için kullanılan bir protein kodlayan genin DNA çift ​​sarmalının tek DNA zinciri olarak adlandırılır .

İki şematik gösterimi , DNA şerit ve elde edilen RNA sırasında transkript transkripsiyonu ile RNA polimeraz . Codogenic veya şablon bükümü “His” ile, “antisens” ile burada ifade edilir olmayan şablon strand DNA. ( Bir kromozomdaki her bir kromatid, uzun bir çift DNA zinciri içerir ; ancak, yoğun halde, transkripsiyonel aktivite çok düşüktür.)

Kodojenik iplik, bir RNA polimerazın , ribonükleotidlerden oluşturulacak transkript için bir şablon olarak kullandığı DNA segmentini içerir . Baz dizisi oluşturulmuş iplik iplik RNA nedenle komplementer için codogenic kullanılan iplik iplik DNA - ve bu nedenle (bu nedenle çoğu zaman, aynı zamanda “kodlama” olarak adlandırılır), diğer kullanılmayan DNA ipliğinden benzemektedir. Bu nedeni dizisi bazlarının , bu DNA segmenti yönlü kalıp olmayan sarmalın tek farklılık , T yerine U RNA sekansı elde kopya.

Aslında proteinleri kodlayan genetik bilgi, açık bir okuma çerçevesi (OLR veya ORF) içinde mRNA üzerinde bulunur . Bu dizi alan bir okuma ile ribozomlar içinde sitoplazma içinde çeviri : bir dizi olarak baz üçlüsü , her biri bir temsil kodonu olduğu ve her biri tek bir için bir amino asit . Sadece bu bağlamda , baz dizisi, bir polipeptit zincirinin oluşturulacağı amino asit dizisini belirttiği, kodladığı başlangıç ​​kodonu ile durdurma kodonu arasındadır . RNA zincirindeki bir kodonun tamamlayıcısı olan kodojenik DNA zincirindeki karşılığına ayrıca bir kodojen ("kodon üreteci ") denir .

İki DNA zincirinden hangisi kodojeniktir ve bir şablon olarak işlev görür , bir genin asimetrik promotörünün konumu ile belirlenir ; bu, bir kromozomun DNA çift sarmalında genden gene değişebilir.

Daha detaylı açıklamalar

DNA çift sarmalı, tamamlayıcı bir şekilde nükleobazlar aracılığıyla zıt yönlerde eşleştirilmiş antiparalel (5'→ 3' veya 3'→ 5') iki tekli iplikten oluşur . Her iki zincirin dış fosfat-şeker çerçevesi arasında, bir RNA polimeraz kompleksinin çift zincir üzerinde kaydığı ve DNA üzerindeki bir promotör bölgesini dizisiyle tanıyabildiği oluklar vardır . Transkripsiyon ancak bu promotöre sıkı bir şekilde bağlandıktan sonra başlayabilir.

Promotör dizisi simetrik değildir ve bu nedenle sadece bir yönde bağlanmaya izin verir. Bağlı RNA polimeraz, böylece yönlendirilmiş olarak konumlandırılır: başlangıç ​​noktası ve transkripsiyon yönü, promotör aracılığıyla belirtilir. RNA polimeraz sadece 5 '→ 3' yönünde bir RNA zinciri sentezleyebilir. Ribonükleotitlerinin dizisi , karşıt DNA zinciri (3'→ 5') ile tamamlayıcı baz eşleşmeleri ile belirlenir . RNA transkripti, transkripsiyonun bittiği terminatöre ulaşılana kadar bu şablon temelinde oluşturulur . RNA polimeraz daha sonra başka bir transkripsiyon işlemi için kullanılabilir. Bir genin promotörünün DNA üzerinde nasıl konumlandırıldığına bağlı olarak, aşağıdaki transkripsiyon çift sarmal ile ilgili olarak bir veya diğer yönde ilerler. Bu nedenle kodojenik zincir her zaman aynı DNA zinciri değildir, daha çok sentez yönünün tersi yönünde uzanan zincirdir.

DNA'dan RNA'ya kopyalanan baz dizisi, her zaman kodojenik sarmalın tamamlayıcısıdır . Kodojenik zincirin kodojeni (3 '→ 5') üzerinde örneğin kodonu CUG (5 '→ 3') temsil eden kodlayıcı RNA üzerinde bir baz üçlüsü oluşturulmuştur . Bu, DNA'nın kodojenik olmayan diğer zincirindeki baz dizilimi (5' → 3') olan bir üçlüye karşılık gelir . Kodon mRNA okunabilir ribozomuna ve yorumlanmalıdır tRNA eşleşen ile antikodonu gibi, (3 '→ 5'). Bu tRNA lösin ile yüklenmişse, bu amino asit bir proteinin elde edilen polipeptit zincirine dahil edilir. Sadece o zaman yapar açık hale proteini kodlayan bir genin genetik bilgi - kodon yana mRNA daha sonra kodlar için Leu (L) ya da codogen DNA ile (3 '→ 5') için tekabül antikodonu bir tRNA ile Leu . GACCTGCUGGACCUGGACGAC

Zaman konuşma a kodlama sarmalı, bir akılda tutulmalıdır tek nükleobaz yeni değişim ile ilgili olmayan şablon iplikçiği , örneğin dönüşüm - DNA sitozin için timin (bir geçiş Cı → T) - olduğu bulunmamaktadır Genetik bilginin çoğaltılması üzerindeki etkisi, sanki bu olay şablon iplikle ilgiliymiş gibi, tek ipliği kodlayan mRNA için kodojenik şablona sahiptir.

Diğer isimler

Terimi çiftleri arasında codogenic ve olmayan codogenic yanı sıra kodlayıcı olmayan ve kodlama ya da codogenic karşı kodlama kullanılan çeşitli için nükleik asit transkripsiyon sırasında tek iplik parçalarının . Diğer yaygın isimler, örneğin şablon iplik ve duyu iplik , eksi iplik ve artı ipliktir . İngilizce antisense ve Sense ( 'anlam' anlamına gelen İngilizce ) Alman uzman literatüründe de kullanılır, daha nadiren, çoğunlukla 5 '→ 3'ten her iki şeridin tek tip bir temsiliyle ilgili olarak, Crick-Strang (anlam) ve Watson-Strang (antisens); ancak bu terimler her zaman aynı anlamda kullanılmazlar.

Ayrıca birçok durumda - (önceden) mRNA olmayan transkripsiyonu yaparken - 'kodojen' ve 'kodlama' gibi terimlerin boş olduğuna da dikkat edilmelidir. Ayrıca bir organizmanın genlerinin transkripsiyonunda her zaman aynı DNA zinciri kodojenik zincir olarak kullanılmadığından, transkripsiyonda tek zincirli bölümlerden bahsetmek daha mantıklıdır. Bu aynı zamanda, tüm genomun iplikçiklerinin veya ipliklerinin “+” veya “artı” veya “-” veya “eksi” ile gösterildiği virüs veya organel genomları durumundaki özel durumlardan ayırt etmek için de gereklidir .

Yaygın kullanımda, kodojenik iplik , şablon iplik , eksi iplik , anlamsız iplik ve antisens terimleri RNA'ya tamamlayıcı olan ve bir transkripsiyon yapan RNA polimeraz için transkript için bir şablon görevi gören DNA iplikçik segmentini belirtir . Nichtcodogener iplik , şablon olmayan , artı iplik , duyu iplik ve sens veya "kodlayıcı iplik" daha sonra bu nükleik asit iplik kısmı için atamalardır, birincil RNA- Ürünlerinin dizisi gene benzer. Bununla birlikte, bazen, protein veya tRNA, farklı bir anlama sahip duyu olarak görülür; bu, ifadelere atanan anlamın daha sonra tersine çevrilebileceği anlamına gelir.

Edebiyat

  • B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis ve diğerleri: Molecular Biology of the Cell. 4. baskı. Garland Science, New York 2002, Bölüm 6: Hücreler Genomu Nasıl Okuyor: DNA'dan Proteine. NCBI kitaplığında çevrimiçi
  • Rolf Knippers: Moleküler Genetik. 8. gözden geçirilmiş baskı. Georg Thieme Verlag, New York NY ve diğerleri 2001, ISBN 3-13-477008-3 .

Bireysel kanıt

  1. ↑ B. Alberts, ve diğerleri: Hücrenin Moleküler Biyolojisi. 4. baskı. Garland Science, New York 2002, Bölüm: DNA'dan RNA'ya. burada çevrimiçi
  2. ↑ bir B JCBN / NC-IUB Bülten 1989
    adlandırılması kuralları
    kodlama şeridi içinde Biochemie der Lexikon ile Spektrum.de 22 Ekim 2017 tarihinde erişilebilir.
  3. ^ Reed Cartwright, Dan Graur: Watson ve Crick'in çoklu kişilikleri . İçinde: Biyoloji Doğrudan . 6, Şubat 2011, s. 7. doi : 10.1186 / 1745-6150-6-7 . PMID 21303550 . PMC 3055211 (ücretsiz tam metin).