Agaroz
| Yapısal formül | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||
| Genel | |||||||
| Soyadı | Agaroz | ||||||
| diğer isimler |
|
||||||
| CAS numarası | 9012-36-6 | ||||||
| Monomerler | D-galaktoz ve 3,6-anhidro-L-galaktoz | ||||||
| Moleküler formül tekrar ünitesinin | C 12 H 18 O 9 | ||||||
| Tekrar eden birimin molar kütlesi | 306,27 g mol −1 | ||||||
| PubChem | 11966311 | ||||||
| Polimer türü | |||||||
| Kısa açıklama |
beyazımsı sarı, kokusuz katı |
||||||
| özellikleri | |||||||
| Fiziksel durum |
sıkıca |
||||||
| yoğunluk |
≈ 0,9 g / cm 3 |
||||||
| Erime noktası |
88 ° C |
||||||
| çözünürlük |
suda kolayca çözünür (ısıtıldığında) |
||||||
| güvenlik talimatları | |||||||
| |||||||
| Mümkün olduğunca ve geleneksel olarak, SI birimleri kullanılır. Aksi belirtilmedikçe, verilen veriler standart koşullar için geçerlidir . | |||||||
Agaroz , glikosidik olarak bağlı olan D-galaktoz ve 3,6-anhidro-L-galaktozdan yapılan bir polisakkarittir . Agarın ana bileşenidir ve esas olarak kırmızı yosun cinsi Gelidium ve Gracillaria'dan elde edilir . Agarın aksine, saflaştırılmış agaroz çok daha az negatif yük içerir . Agaroz, güçlü bir jelleştirici ajandır ve agarın jelleşme kabiliyetinden sorumludur.
Agaroz jel , maddelerin elektroforetik olarak ayrılması için agaroz jel elektroforezinde kullanılan bir jelin adıdır , örn. B. nükleik asitler veya proteinler tarafından kullanılır . Agarozun bir tampon içinde , örneğin TBE tamponunda , TAE tamponunda veya LB tamponunda kaynatılmasıyla hazırlanır . Tampondaki agaroz konsantrasyonu, jel elektroforezi ile ayrılacak partiküllerin boyutuna bağlıdır, bu sayede daha küçük partiküller için daha yüksek yüzdeli agaroz jel ile daha iyi bir ayırma (uzamsal çözünürlük), daha düşük olan daha büyük partiküller için elde edilebilir. yüzde jel. Plazmitlerin agaroz jel elektroforezi ve bunların sınırlama fragmanları için, örneğin jel tamponunda% 0.7 ila 1.2 agaroz konsantrasyonu genellikle kullanılır.
| % (W / v) cinsinden agaroz konsantrasyonu | BP cinsinden ayırma alanı |
|---|---|
| 0.5 | 1000-30000 |
| 0.7 | 800-12000 |
| 1.0 | 500-10000 |
| 1.2 | 400-7000 |
| 1.4 | 200-4000 |
| 2.0 | 50-2000 |
RNA'yı ayırmak için özel formaldehit içeren jeller kullanılmalıdır. Çoğunlukla, ayrılan molekülleri görünür kılmak için üretim sırasında jellere yardımcı maddeler eklenir. DNA söz konusu olduğunda, bu genellikle etidyum bromürdür .
Agar veya agarozun diğer uygulamaları, immünodifüzyon ( Ouchterlony testi veya Ouchterlony çift immünodifüzyon ) veya immünoelektroforez teknikleriyle ilgilidir . Çapraz bağlı ticari ismi altında agaroz Sepharose satılan için Se paration- Pha rmacia-aga gül standlarını. Sepharose, biyomoleküllerin kromatografik ayrılması için sabit bir faz olarak kullanılır . İle Protein A veya Protein G, kaplanmış Sefaroz boncukları ( İngilizce boncuklar ) kullanılan immün presipitasyon kullanılır.
Dünyanın en büyük özel toz üretim tesisi olan Lonza Rockland , Rockland, Maine'de bulunmaktadır .
Edebiyat
- Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer : Biyokimya. 6. baskı, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2007, ISBN 978-3-8274-1800-5 .
- Donald Voet, Judith G. Voet: Biyokimya. 3. baskı, John Wiley & Sons, New York 2004, ISBN 0-471-19350-X .
- Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts: Hücrenin Moleküler Biyolojisi . 6. baskı, Taylor & Francis, London 2008, ISBN 978-0815341062 .
Bireysel kanıt
- ↑ üzerinde giriş Agaroz içinde bir Cosing veritabanı AB Komisyonu, 28 Aralık 2020 tarihinde erişti.
- ↑ a b c Agarose veri sayfası (PDF), Carl Roth'tan , 14 Aralık 2010'da erişildi.
- ↑ Agarose veri sayfası , PFGE at Avantor Performance Materials , 9 Ekim 2014'te erişildi.
- ↑ Veri sayfası sayfası artık mevcut değildir , web arşivlerinde arama yapın: AppliChem'de Agarose MP (PDF; 63 kB), 9 Ekim 2014'te erişildi.
- ↑ Rockland, ME (ABD). Lonza Locations Worldwide, erişim tarihi 17 Kasım 2017.