Peptidazlar

Peptıdazlar (peptit bağı hidrolaz kısaltması) olan enzimler için klivaj proteinler ya da peptidler . Bunu yaparken , peptit bağlarının hidrolizini katalize ederler . Peptidazlar, özellikle daha büyük proteinler bölündüğünde sıklıkla proteazlar , proteinazlar veya proteolitik enzimler olarak da anılır .

Oluşumu ve işlevi

Peptidazlar her yerde bulunur; yani, tüm organizmaların tüm doku ve hücrelerinde meydana gelirler . Hücre içi ve hücre dışı peptidazlar arasında bir ayrım yapılır .

Hücre içi peptidazlar, çok sayıda hücre bölmesinde çok çeşitli görevleri yerine getirir. Hücrenin protein içeriğinin çeviri sonrası düzenlenmesine bu şekilde katılırlar :

• Peptidazların kendileri de dahil olmak üzere proteinler, üretimlerinden sonra ( protein biyosentezine bakınız ) peptit parçalarını ayırarak ( sınırlı proteoliz ) aktif duruma dönüştürülür .
• Yeni sentezlenen proteinlerin doğru hedeflerine ulaşmasını sağlayan sinyal peptidleri, sinyal peptidazları tarafından ayrılır.
• Peptidazlar, büyük, çok alt birimli peptidaz kompleksi olan proteazom ile antijenlerin parçalanmasında rol oynarlar .
• Proteinler artık gerekli değilse veya hasar görürlerse, lizozomlardaki peptidazlar tarafından parçalanırlar. Tüm ökaryotik hücreler ayrıca sitozolde bulunan ATP'ye bağımlı bir proteolitik sisteme sahiptir .

Hücre dışı olarak salgılanan peptidazlar, hayvan organizmalarında, esas olarak, yiyeceklerin hidrolitik parçalanmasını katalize ettikleri sindirim sisteminde bulunur . Ayrıca, bazen kan pıhtılaşma sisteminin peptidazları , tamamlayıcı sistem ve fibrinolitik sistem gibi oldukça spesifik görevleri üstlendikleri diğer hücre dışı sıvılarda da bulunurlar .

Tarafından peptidaz inhibitörleri , düşük molekül ağırlıklı maddeler, örneğin. B. Antikoagülanlar rivaroksaban , pepstatin , iyot asetat veya fenantrolin , fonksiyonlarında peptidazları inhibe edebilir.

Peptidazlar ve diğer enzimler de kiri parçalamak ve dolayısıyla bu maddelerin etkinliğini artırmak için temizlik maddelerinde bulunabilir.

Tümör oluşumunda peptidazların önemi

Peptidazlar , kötü huylu tümörlerin metastazında önemli bir rol oynar . Kötü huylu katı tümörlerden metastaz gelişimi için, tümör hücrelerinin kollajen (tip IV), laminin ve heparin sülfat proteoglikanlardan oluşan bazal membranı geçmesi gerekir . Serin proteinazlar , katepsin proteinazlar ve matriks metaloproteinazlar gibi peptidazlar bunların üstesinden gelmede önemli bir rol oynarlar .

Peptidazların sınıflandırılması

EC isimlendirme

Diğer tüm enzimler gibi, peptidazlar da EC sistemi olarak adlandırılan sistem kullanılarak gruplara ayrılır. Peptidazlar, hidrolazların 3. sınıfına aittir ve burada alt sınıf 3.4'ü oluşturur. Bu da 14 alt sınıfa ayrılmıştır. Bu isimlendirme , katalize edilen reaksiyon tipine ve aktif merkeze dayanmaktadır.
 

Katalize edilen proteolitik reaksiyon türü

Enzimler çok çeşitli kimyasal reaksiyonları katalize edebildiğinden, onları bu reaksiyonlara göre sınıflandırmak mantıklıdır. Enzimolojik bir bakış açısından peptidazların birinci bölümü , ekzopeptidazlar ve endopeptidazlardır .

Ekzopeptidazlar, polipeptit zincirini uçlardan ayırır . N-terminalinde hareket edenler, bölünmüş parçaya bağlı olarak aminopeptidazlar ( tek bir amino asidin salımı), dipeptidil peptidazlar (bir dipeptidin salımı ) veya tripeptidil peptidazlar (bir tripeptidin salımı ) olarak adlandırılır . C-terminalinde hareket eden ekzopeptidazlar , tek tek amino asitleri ( karboksipeptidazlar ) veya dipeptitleri (peptidil dipeptidazlar) salar . Ek olarak, dipeptitleri (dipeptidazlar) spesifik olarak ayıran veya terminal ikameli , siklize veya izopeptit bağlantılı amino asitleri (omega-peptidazlar) çıkaran ekzopeptidazlar vardır .

Endopeptidazlar genellikle polipeptid zinciri içinde çok spesifik noktalarda bölünürler. Özgüllüğe dayalı tatmin edici bir sınıflandırma mümkün değildir. Bu nedenle, alt bölüm, aktif merkeze dayanmaktadır ( aşağıya bakınız ). Bölünecek polipeptid zincirinin uzunluğu, endopeptidazlar durumunda geniş bir aralık içinde değişebilir. Çoğunlukla proteinler substrattır . Bununla birlikte, substratlar (oligopeptidazlar) olarak daha kısa peptitlerde uzmanlaşmış bir endopeptidaz alt grubu da vardır.

Aktif merkez türü (MEROPS)

EC sistemine göre peptidazların alt bölümünün zayıf yönleri vardır. Çok sayıda endopeptidaz, yalnızca altı alt sınıfla temsil edilir. Aynı grupta farklı tipte peptidazlar bulunabilir. Bununla birlikte en ciddi dezavantaj, tek tek enzimler arasındaki yapısal, evrimsel benzerliklerin hesaba katılmamasıdır.

Bu amaçla, Neil D. Rawlings ve Alan J. Barett, 1993 yılında, amino asit dizisine dayalı yapısal yönleri ve evrimsel ilişkileri hesaba katan MEROPS adlı yeni bir sınıflandırma şeması sundular .

Tüm enzimler gibi, peptidazlar da ilgili reaksiyonu mümkün kılan aktif bir merkeze sahiptir - bu durumda peptid bağlarının hidrolizi. Bu merkezler içinde, bazı veya amino asit grupları işlevsellik açısından çok önemlidir. Bu nedenle peptidazlar, katalitik, aktif merkezlerinin kimyasal yapısına göre MEROPS veritabanında altı gruba ayrılır ( aşağıdaki tabloya bakın ):

Peptidazlara genel bakış

Akrosin , aminopeptidaz B , bromelain , kalpain I , karboksipeptidaz A , katepsin A , katepsin B , katepsin D , katepsin E , katepsin K , kimotripsin , kolajenaz , dipeptidil peptidaz 4 , dispaz , elastaz , faktör IIa , faktör Xa , fiseptid , gpr endopeptid , HIV proteaz , kallikrein , MBTPS1 , papain , pepsin , plazmin , prepilin tip IV peptidaz , prolil oligopeptidaz , proteinaz K , proteazom , renin , sekretazlar ( alfa , beta ve gama sekretaz ), termolisin , trombin , tripsin , Ürokinaz

Ayrıca bakınız

• Azokaz testi
• Renin-Anjiyotensin-Aldosteron Sistemi

İnternet linkleri

• MEROPS - peptidaz veritabanı (İngilizce)

Bireysel kanıt

1. ↑  ( Sayfa artık mevcut değil , web arşivlerinde ara ) (PDF)@ 1@ 2Şablon: Toter Link / www.uni-marburg.de