Mamastro virüsü
İnsan astrovirüsleri | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Elektron mikroskobu altında insan astrovirüsleri | ||||||||||||||||
sistematik | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Taksonomik özellikler | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Ayrıldı | ||||||||||||||||
|
Cins Mamastrovirus içeren virüsleri arasında Astroviridae ailesinin enfekte Mammalia adının kökeni açıklar (memeliler ve özellikle insanlarda). Kasım 2018 itibarıyla, Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV), bu cinste GI ve GII olmak üzere iki genogruba bölünmüş 19 türü ( Mamastrovirus 1 ila 19 ) onaylamıştır ; Tür türü, insan patojenik Mamastrovirus 1'dir (GI). Bu türden insan patojenik insan astrovirüsleri, 1975 yılında bir ishal salgınından dışkı örneklerinde elektron mikroskobik tanımlama yardımıyla insanlarda ilk kez tanımlandı . Bu arada, birkaç farklı virüs türü insan astrovirüsleri (yani insan patojenik mamastrovirüsleri) olarak tanımlanmıştır: Mamastrovirüs 6 (ayrıca GI) ve Mamastrovirüs 8 ve 9 (her ikisi de GII). Buna ek olarak, çok benzer virüsler, Mamastrovirus cinsine de yerleştirilen diğer bazı memeli türlerinden de izole edilebilir ve kediler (kedi), domuzlar (domuz), deniz aslanları, köpekler (köpek), yunuslar, vizon (musteline), Koyun (koyun) ve yarasalar. Örneğin ördek, tavuk ve hindi gibi kuşlarda meydana gelen benzer patojenler listelenen ikinci cins olarak Avastrovirus (üç türle Avastrovirus 1 ile 3 ) ailesi içinde Astroviridae .
Astroviridae gibi Caliciviridae ve Picornaviridae vardır zarfsız , tek sarmallı RNA virüsleri ile olumlu polarite .
hastalık
İnsan astrovirüsleri, dünya çapında, özellikle çocuklarda ve aynı zamanda yetişkinlerde gastroenterite neden olan ajan olarak tanımlanmıştır. Belirtileri enfeksiyon olan ishal , kusma , ateş, karın ağrısı. Hastalık ortalama 3 ila 4 gün sürer ancak genellikle tehlikeli bir durum değildir, nadir durumlarda su kaybı da meydana gelebilir. Kısa bir süre sonra semptomlar kendiliğinden geçtiği için enfekte kişilerin yatarak tedaviye ihtiyacı yoktur.
Teşhis
Virüs teşhisi sırasında elektron mikroskobu , ELISA , immünofloresan ve PCR , enfekte kişilerin dışkısında viryonları , antijenleri veya viral RNA'yı tespit etmek için kullanılabilir .
Epidemiyoloji
Birleşik Krallık'ta 1999'da yayınlanan bir çalışma, yılda 1000 kişi başına 3,8 uygunsuzluk buldu ve astrovirüsü viral gastroenteritin dördüncü en yaygın nedeni haline getirdi. Amerika Birleşik Devletleri'nde yapılan araştırmalar, semptomları olan çocukların yüzde 2 ila 9'unun dışkısında astrovirüsler buldu. Hastalık en çok 2 yaşın altındaki çocuklarda görülür, ancak yetişkinlerde de salgınlar olmuştur. Glasgow ve ABD'den yapılan araştırmalar, astrovirüs enfeksiyonunun genellikle semptomsuz olduğunu göstermektedir . Ilıman iklime sahip bölgelerde astrovirüs enfeksiyonları kışın daha sık görülürken, tropik bölgelerde enfeksiyonların çoğu yağmurlu mevsimde meydana gelir. Astrovirüsler kontamine su veya kontamine gıda yoluyla bulaşır.
Önleme
Astrovirüsler için aşılama veya antiviral tedavi yoktur , ancak kişisel hijyen enfeksiyon riskini azaltabilir.
Ana bilgisayar spektrumu
Astrovirüslerin önceden bilinen konakçı aralığı (eşanlamlı tropizm ) insanları, keçileri, sığırları, koyunları, domuzları, geyikleri, yarasaları ve deniz aslanlarını içerir.
inşaat
Astrovirüsler, 28 ila 35 nm çapında zarfsız ikosahedral virüslerdir ve kendilerine isimlerini veren ve elektron mikroskobu altında görülebilen karakteristik yıldız şekilli yüzey yapısıdır.
Genetik şifre
Genomu insan astrovirus pozitif polariteye sahip tek RNA sarmalının oluşur ve sahip poli-A kuyruğu ile 3 'ucuna , ancak 5' Cap yapısına . Poli-A kuyruğu olmadan astrovirüs genomu 6.8-7.9 kbp uzunluğundadır. ORF1a ve ORF1b 70 bp ile örtüşen üç açık okuma çerçevesi içerir . Üçüncü açık okuma çerçevesine ORF2 adı verilir. Mutasyon oranı, bölge ve yıl başına 3,7 x 10 −3 nükleotid değişimi ve bölge ve yıl başına 2,8 x 10 −3 nükleotid değişimi eşanlamlı bir değişim oranı olarak belirlendi .
sistematik
Göre ICTV (2018 Kasım) ve (2017) Donato / Vijaykrishna, sistem aşağıdaki gibi olduğu:
- Astroviridae ailesi
-
- Cins Mamastrovirus
-
- Genogrup GI
- Tür Mamastrovirüs 1 ( insan astrovirüs GI-A , tür türleri, GI.A-insan)
- Tür Mamastrovirus 2 ( kedi astrovirüs , GI.B-kedi)
- Tür Mamastrovirus 3 ( domuz astrovirüsü , GI.C-domuz)
- Tür Mamastrovirus 4 ( Deniz Aslanı Astrovirus GI-D , GI.D-California deniz aslanı)
- Tür Mamastrovirus 5 ( köpek astrovirüs , GI.E-köpek)
- Tür Mamastrovirus 6 ( insan astrovirüs GI-F , GI.F-insan)
- Tür Mamastrovirus 7 ( şişe burunlu yunus astrovirus , GI.G-şişe burunlu yunus)
- Genogrup GII
- Tür Mamastrovirus 8 ( insan astrovirüs GII-A , GII.A-insan)
- Tür Mamastrovirus 9 ( İnsan Astrovirüs GII-B , GII.B-insan)
- Tür Mamastrovirus 10 ( Mink Astrovirus , GII.C-vizon)
- Tür Mamastrovirus 11 ( Deniz Aslanı Astrovirus GII-D , GII.D-California deniz aslanı)
- Tür Mamastrovirus 12 ( yarasa astrovirüs GII-E , GII.E-yarasa)
- Tür Mamastrovirus 13 ( koyun astrovirus , GII.F-ovine)
- Türlere Mamastrovirus 14 - 19 ( bat astrovirüs GII-G için GII-L , GII.L-bat GII.G-bat)
Resmi olarak tanınan bu türlere ek olarak, bir dizi başka öneri de var.
Edebiyat
- David M. Knipe, Peter M. Howley , Diane E. Griffin, (Eds.): Fields Virology . 5. baskı, Lippincott Williams & Wilkins Verlag, 2007. ISBN 978-0-7817-6060-7 .
Bireysel kanıt
- ↑ ICTV Ana Tür Listesi 2018b v2 MSL # 34v, Mart 2019
- ↑ a b c d ICTV: ICTV Ana Türler Listesi 2019.v1 , 2018b sürümünden bu yana tüm takson güncellemelerini içeren Yeni MSL, Mart 2020 (MSL # 35)
- ↑ SIB: Astroviridae , üzerinde: ViralZone
- ↑ a b Celeste Donato, Dhanasekaran Vijaykrishna: The Broad Host Range and Genetic Diversity of Mammalian and Avian Astroviruses , in: Viruses 2017, 9 (5), 102; doi: 10.3390 / v9050102 (İnceleme)
- ^ DW Brown, KB Gunning, DM Henry, ZL Awdeh, JP Brinker, S. Tzipori, JE Herrmann: İnsan astrovirüs serotiplerini tespit etmek için bir DNA oligonükleotid mikro dizisi. İn: J Virol Methods (2008), Cilt 147 (1), s 86-92... PMID 17905448 , PMC 2238180 (ücretsiz tam metin).
- ↑ P. De Benedictis, S. Schultz-Cherry, A. Burnham, G. Cattoli: İnsanlarda ve hayvanlarda astrovirüs enfeksiyonları - moleküler biyoloji, genetik çeşitlilik ve türler arası aktarımlar. In: Infect Genet Evol. (2011), Cilt 11 (7), s. 1529-44. PMID 21843659 .
- ↑ Madeley CR: Hastanede virüs ishali . İçinde: J. Hosp. Infect. . 12, No. 3, 1988, s. 145-9. doi : 10.1016 / 0195-6701 (88) 90001-1 . PMID 2904454 .
- ^ Glass RI, Noel J, Mitchell D ve diğerleri. : Astrovirüs ile ilişkili gastroenteritin değişen epidemiyolojisi: bir inceleme . İçinde: Arch Virol. Suppl . 12, 1996, s. 287-300. PMID 9015126 .
- ^ NK Krishna: Astrovirüs kapsid biyolojisinde yer alan yapısal alanların tanımlanması. In: Viral Immunology. (2005), Cilt 18 (1), sayfa 17-26. PMID 15802951 ; PMC 1393289 (ücretsiz tam metin).
- ↑ Willcocks MM, Brown TD, Madeley CR, Carter MJ: Bir insan astrovirüsünün tam dizisi . İçinde: J. Gen. Virol. . 75 (pt 7), No. 7, 1994, s. 1785-8. doi : 10.1099 / 0022-1317-75-7-1785 . PMID 8021608 .
- ↑ IV Babkin, AY Tikunov, EV Zhirakovskaia, SV Netesov, NV Tikunova: insan astrovirüsünün yüksek evrimsel oranı. In: Infect Genet Evol. (2012), Cilt 12 (2), sayfa 435-42. PMID 22326537 .
- ↑ ICTV : Ana Türler Listesi 2018a v1 , 2017 sürümünden bu yana tüm takson güncellemelerini içeren MSL. 2018 Güz (MSL # 33)
- ↑ ICTV : Pozitif Anlamda RNA Virüsleri> Pozitif Anlamda RNA Virüsleri: Astroviridae , ICTV 9. Raporu (2011)